RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637273.1

PLCB1-231, Transcript of phospholipase C beta 1, human

TSL 5

Gene PLCB1, Length 1,669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLCB1-231	ENST00000637273	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PLCB1-231	ENST00000637273	MAPKBP1	O60336	1514 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PLCB1-231	ENST00000637273	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PLCB1-231	ENST00000637273	ANP32C	O43423	234 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PLCB1-231	ENST00000637273	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PLCB1-231	ENST00000637273	P3H3	Q8IVL6	736 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PLCB1-231	ENST00000637273	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PLCB1-231	ENST00000637273	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.52	□□□□□ -0.56
PLCB1-231	ENST00000637273	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PLCB1-231	ENST00000637273	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PLCB1-231	ENST00000637273	PYGB	P11216	843 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PLCB1-231	ENST00000637273	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PLCB1-231	ENST00000637273	WDR97	A6NE52	1622 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PLCB1-231	ENST00000637273	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PLCB1-231	ENST00000637273	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
PLCB1-231	ENST00000637273	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PLCB1-231	ENST00000637273	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.46	□□□□□ -0.58
PLCB1-231	ENST00000637273	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		11.46	□□□□□ -0.58
PLCB1-231	ENST00000637273	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PLCB1-231	ENST00000637273	TIAM1	Q13009	1591 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PLCB1-231	ENST00000637273	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PLCB1-231	ENST00000637273	WDR70	Q9NW82	654 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PLCB1-231	ENST00000637273	ITGAE	P38570	1179 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PLCB1-231	ENST00000637273	KIF27	Q86VH2	1401 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PLCB1-231	ENST00000637273	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PLCB1-231	ENST00000637273	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PLCB1-231	ENST00000637273	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	TONSL	Q96HA7	1378 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	UACA	Q9BZF9	1416 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PLCB1-231	ENST00000637273	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	CUX1	P39880	1505 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	NCAPD3	P42695	1498 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	MFRP	Q9BY79	579 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	PSEN1	P49768	467 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PLCB1-231	ENST00000637273	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	HMGXB3	Q12766	1538 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	IGF1R	P08069	1367 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	PRDM2	Q13029	1718 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	E2F4	Q16254	413 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	NCOA1	Q15788	1441 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	NLRP6	P59044	892 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	AKNA	Q7Z591	1439 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLCB1-231	ENST00000637273	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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