RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628102.2

PCBP1-AS1-321, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 644 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.2■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 P3H3Q8IVL6 736 aa16.19■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PTPRTO14522 1441 aa16.17■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.15■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MLECQ14165 292 aa16.15■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.15■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ATP10AO60312 1499 aa16.15■□□□□ 0.18
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.14■□□□□ 0.17
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.14■□□□□ 0.17
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 C3P01024 1663 aa16.13■□□□□ 0.17
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.12■□□□□ 0.17
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.09■□□□□ 0.17
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PLCH2O75038 1416 aa16.07■□□□□ 0.16
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 REREQ9P2R6 1566 aa16.07■□□□□ 0.16
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 KDM5CP41229 1560 aa16.04■□□□□ 0.16
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.03■□□□□ 0.16
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 NCOA1Q15788 1441 aa16.02■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.01■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 AGLP35573 1532 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MROH2AA6NES4 1674 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ABCA6Q8N139 1617 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.94■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 KIF14Q15058 1648 aa15.94■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.94■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.93■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.93■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.91■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.91■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 NPATQ14207 1427 aa15.91■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.9■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.9■□□□□ 0.14
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 AFAP1Q8N556 730 aa15.89■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PLA2R1Q13018 1463 aa15.88■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.86■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.86■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PREX2Q70Z35 1606 aa15.86■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 EEA1Q15075 1411 aa15.85■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ABCC1P33527 1531 aa15.85■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PKD2Q13563 968 aa15.84■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.84■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 FMN1Q68DA7 1419 aa15.83■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CLIP1P30622 1438 aa15.82■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.81■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.8■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ZMYM3Q14202 1370 aa15.79■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CPS1P31327 1500 aa15.78■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 HSPA1LP34931 641 aa15.77■□□□□ 0.12
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TOM1O60784 492 aa15.75■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.75■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.74■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PTPRKQ15262 1439 aa15.73■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PLXNC1O60486 1568 aa15.73■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.7■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.7■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.7■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PIP4K2BP78356 416 aa15.69■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.69■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.69■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ATP7AQ04656 1500 aa15.68■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ALKQ9UM73 1620 aa15.67■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.66■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.66■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.65■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 A2MP01023 1474 aa15.65■□□□□ 0.1
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 DEPDC5O75140 1603 aa15.63■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.6■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.6■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.6■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SYNMO15061 1565 aa15.6■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.59■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 IQGAP1P46940 1657 aa15.59■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MED14O60244 1454 aa15.59■□□□□ 0.09
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 GGT6Q6P531 493 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms