RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 IGF1RP08069 1367 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 MORC1Q86VD1 984 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS3P49796 1198 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-208ENST00000615445 BECN1Q14457 450 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-208ENST00000615445 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-208ENST00000615445 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-208ENST00000615445 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-208ENST00000615445 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-208ENST00000615445 SOX12O15370 315 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-208ENST00000615445 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-208ENST00000615445 NCAPD3P42695 1498 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-208ENST00000615445 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-208ENST00000615445 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPRGP23470 1445 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRJ-208ENST00000615445 RALBP1Q15311 655 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRJ-208ENST00000615445 MS4A1P11836 297 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRJ-208ENST00000615445 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRJ-208ENST00000615445 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRJ-208ENST00000615445 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PTPRJ-208ENST00000615445 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PTPRJ-208ENST00000615445 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
PTPRJ-208ENST00000615445 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PTPRJ-208ENST00000615445 CASC1Q6TDU7 716 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPRJ-208ENST00000615445 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRJ-208ENST00000615445 NLRP13Q86W25 1043 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-208ENST00000615445 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF21BO75037 1637 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-208ENST00000615445 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-208ENST00000615445 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-208ENST00000615445 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 CFTRP13569 1480 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRJ-208ENST00000615445 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PANK3Q9H999 370 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OSCARQ8IYS5 282 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA2Q08379 1002 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNJ1O43426 1573 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 USP47Q96K76 1375 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF15Q9NS87 1388 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 EID1Q9Y6B2 187 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ARAP1Q96P48 1450 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 NUTM2FA1L443 756 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 PDE3BQ13370 1112 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 NESP48681 1621 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 APBB1O00213 710 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNJ4P48050 445 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 UACAQ9BZF9 1416 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRJ-208ENST00000615445 GRIN2BQ13224 1484 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CUX1P39880 1505 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 NCOA2Q15596 1464 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 NPHP1O15259 732 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 FGD1P98174 961 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 PRXQ9BXM0 1461 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRJ-208ENST00000615445 HSCBQ8IWL3 235 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 EVC2Q86UK5 1308 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM2Q13029 1718 aa26.21■■□□□ 1.79
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