RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613013.1

UBXN8-206, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN8, Length 528 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-206ENST00000613013 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.19■□□□□ 0.02
UBXN8-206ENST00000613013 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
UBXN8-206ENST00000613013 MLECQ14165 292 aa15.17■□□□□ 0.02
UBXN8-206ENST00000613013 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.16■□□□□ 0.02
UBXN8-206ENST00000613013 STRCQ7RTU9 1775 aa15.14■□□□□ 0.01
UBXN8-206ENST00000613013 HSPA1LP34931 641 aa15.14■□□□□ 0.01
UBXN8-206ENST00000613013 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.14■□□□□ 0.01
UBXN8-206ENST00000613013 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.13■□□□□ 0.01
UBXN8-206ENST00000613013 PTPRTO14522 1441 aa15.1■□□□□ 0.01
UBXN8-206ENST00000613013 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
UBXN8-206ENST00000613013 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.09■□□□□ 0.01
UBXN8-206ENST00000613013 PIP4K2BP78356 416 aa15.08■□□□□ 0
UBXN8-206ENST00000613013 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
UBXN8-206ENST00000613013 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.05■□□□□ -0
UBXN8-206ENST00000613013 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.03■□□□□ -0
UBXN8-206ENST00000613013 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.03■□□□□ -0
UBXN8-206ENST00000613013 IGF1RP08069 1367 aa15.02■□□□□ -0
UBXN8-206ENST00000613013 DISP1Q96F81 1524 aa15.02□□□□□ -0.01
UBXN8-206ENST00000613013 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.01□□□□□ -0.01
UBXN8-206ENST00000613013 FANCAO15360 1455 aa15□□□□□ -0.01
UBXN8-206ENST00000613013 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
UBXN8-206ENST00000613013 ARID3CA6NKF2 412 aa14.98□□□□□ -0.01
UBXN8-206ENST00000613013 IQGAP2Q13576 1575 aa14.97□□□□□ -0.01
UBXN8-206ENST00000613013 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN8-206ENST00000613013 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.96□□□□□ -0.02
UBXN8-206ENST00000613013 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.96□□□□□ -0.02
UBXN8-206ENST00000613013 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN8-206ENST00000613013 AKNAQ7Z591 1439 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN8-206ENST00000613013 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
UBXN8-206ENST00000613013 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
UBXN8-206ENST00000613013 TOM1O60784 492 aa14.92□□□□□ -0.02
UBXN8-206ENST00000613013 NEO1Q92859 1461 aa14.92□□□□□ -0.02
UBXN8-206ENST00000613013 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.9□□□□□ -0.02
UBXN8-206ENST00000613013 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN8-206ENST00000613013 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN8-206ENST00000613013 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN8-206ENST00000613013 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
UBXN8-206ENST00000613013 NCOA1Q15788 1441 aa14.85□□□□□ -0.03
UBXN8-206ENST00000613013 KIAA0556O60303 1618 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN8-206ENST00000613013 POTEAQ6S8J7 498 aa14.83□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 KIF27Q86VH2 1401 aa14.83□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 SPDYE6P0CI01 402 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 ABCA8O94911 1581 aa14.78□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.78□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 RICTORQ6R327 1708 aa14.78□□□□□ -0.04
UBXN8-206ENST00000613013 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 ATP10BO94823 1461 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.72□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 AKT1S1Q96B36 256 aa14.72□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 ATP10AO60312 1499 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 PKD2Q13563 968 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
UBXN8-206ENST00000613013 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN8-206ENST00000613013 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN8-206ENST00000613013 HECW1Q76N89 1606 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN8-206ENST00000613013 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN8-206ENST00000613013 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN8-206ENST00000613013 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN8-206ENST00000613013 PTPRKQ15262 1439 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN8-206ENST00000613013 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN8-206ENST00000613013 C3P01024 1663 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN8-206ENST00000613013 P3H3Q8IVL6 736 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN8-206ENST00000613013 GOLGA3Q08378 1498 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN8-206ENST00000613013 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN8-206ENST00000613013 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN8-206ENST00000613013 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN8-206ENST00000613013 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN8-206ENST00000613013 CPS1P31327 1500 aa14.58□□□□□ -0.08
UBXN8-206ENST00000613013 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.57□□□□□ -0.08
UBXN8-206ENST00000613013 TRIM52Q96A61 297 aa14.57□□□□□ -0.08
UBXN8-206ENST00000613013 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.57□□□□□ -0.08
UBXN8-206ENST00000613013 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.56□□□□□ -0.08
UBXN8-206ENST00000613013 ALKQ9UM73 1620 aa14.55□□□□□ -0.08
UBXN8-206ENST00000613013 PLA2R1Q13018 1463 aa14.54□□□□□ -0.08
UBXN8-206ENST00000613013 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
UBXN8-206ENST00000613013 AFAP1Q8N556 730 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN8-206ENST00000613013 NPATQ14207 1427 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN8-206ENST00000613013 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN8-206ENST00000613013 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN8-206ENST00000613013 ZMYM3Q14202 1370 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN8-206ENST00000613013 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
UBXN8-206ENST00000613013 FKBP8Q14318 412 aa14.46□□□□□ -0.09
UBXN8-206ENST00000613013 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN8-206ENST00000613013 HRCP23327 699 aa14.43□□□□□ -0.1
UBXN8-206ENST00000613013 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.43□□□□□ -0.1
UBXN8-206ENST00000613013 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
UBXN8-206ENST00000613013 PITPNM1O00562 1244 aa14.42□□□□□ -0.1
UBXN8-206ENST00000613013 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms