RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.64■■□□□ 1.86
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM6BO15054 1643 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP10BO94823 1461 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTPRGP23470 1445 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF14Q15058 1648 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHD1O14646 1710 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCOA1Q15788 1441 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADGRL2O95490 1459 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHROOM2Q13796 1616 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOXD1Q16676 465 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSPY4P0CV99 314 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSPY10P0CW01 314 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PZPP20742 1482 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXC-AS2-202ENST00000604081 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCC2Q92887 1545 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PREX2Q70Z35 1606 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MBD5Q9P267 1494 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANP32CO43423 234 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF15Q9NS87 1388 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PKD2Q13563 968 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCER2I3L3R5 266 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUP155O75694 1391 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNH8Q96L42 1107 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.08■■□□□ 1.76
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLXNC1O60486 1568 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC7Q96M83 1385 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UNC13BO14795 1591 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCC1P33527 1531 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERBINQ96RT1 1412 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP47Q96K76 1375 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
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