RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602111.5

FCHO1-236, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-236ENST00000602111 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-236ENST00000602111 STRCQ7RTU9 1775 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-236ENST00000602111 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-236ENST00000602111 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-236ENST00000602111 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-236ENST00000602111 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-236ENST00000602111 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-236ENST00000602111 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-236ENST00000602111 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-236ENST00000602111 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-236ENST00000602111 ATP10AO60312 1499 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-236ENST00000602111 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-236ENST00000602111 PLCH2O75038 1416 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-236ENST00000602111 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.64■■□□□ 1.38
FCHO1-236ENST00000602111 PTPRTO14522 1441 aa23.64■■□□□ 1.37
FCHO1-236ENST00000602111 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-236ENST00000602111 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-236ENST00000602111 C3P01024 1663 aa23.61■■□□□ 1.37
FCHO1-236ENST00000602111 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-236ENST00000602111 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-236ENST00000602111 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.55■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 KDM5CP41229 1560 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 AFAP1Q8N556 730 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 KIF14Q15058 1648 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 ABCA6Q8N139 1617 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 NCOA1Q15788 1441 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-236ENST00000602111 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
FCHO1-236ENST00000602111 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-236ENST00000602111 REREQ9P2R6 1566 aa23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-236ENST00000602111 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.47■■□□□ 1.35
FCHO1-236ENST00000602111 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.46■■□□□ 1.35
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
FCHO1-236ENST00000602111 AGLP35573 1532 aa23.41■■□□□ 1.34
FCHO1-236ENST00000602111 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.4■■□□□ 1.34
FCHO1-236ENST00000602111 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.39■■□□□ 1.34
FCHO1-236ENST00000602111 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.36■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.36■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 CLIP1P30622 1438 aa23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 EEA1Q15075 1411 aa23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 ABCC1P33527 1531 aa23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.34■■□□□ 1.33
FCHO1-236ENST00000602111 FMN1Q68DA7 1419 aa23.33■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 NPATQ14207 1427 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 MROH2AA6NES4 1674 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 PREX2Q70Z35 1606 aa23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-236ENST00000602111 ZMYM3Q14202 1370 aa23.27■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 HSPA1LP34931 641 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 PIP4K2BP78356 416 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 PLA2R1Q13018 1463 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 PKD2Q13563 968 aa23.22■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.21■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.21■■□□□ 1.31
FCHO1-236ENST00000602111 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-236ENST00000602111 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.18■■□□□ 1.3
FCHO1-236ENST00000602111 PTPRKQ15262 1439 aa23.17■■□□□ 1.3
FCHO1-236ENST00000602111 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
FCHO1-236ENST00000602111 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.17■■□□□ 1.3
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
FCHO1-236ENST00000602111 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 ATP7AQ04656 1500 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 PLXNC1O60486 1568 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 TOM1O60784 492 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 GGT6Q6P531 493 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 CPS1P31327 1500 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 A2MP01023 1474 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-236ENST00000602111 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-236ENST00000602111 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-236ENST00000602111 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-236ENST00000602111 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-236ENST00000602111 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-236ENST00000602111 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-236ENST00000602111 ALKQ9UM73 1620 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-236ENST00000602111 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-236ENST00000602111 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
FCHO1-236ENST00000602111 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-236ENST00000602111 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.97■■□□□ 1.27
FCHO1-236ENST00000602111 TNRQ92752 1358 aa22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-236ENST00000602111 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.93■■□□□ 1.26
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