RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCC5O15440 1437 aa23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF14Q15058 1648 aa23.61■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.61■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.59■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.58■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHD1O14646 1710 aa23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.53■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM52Q96A61 297 aa23.53■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP10BO94823 1461 aa23.5■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADGRL2O95490 1459 aa23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SHROOM2Q13796 1616 aa23.46■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCOA1Q15788 1441 aa23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.41■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPRGP23470 1445 aa23.4■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.4■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PZPP20742 1482 aa23.36■■□□□ 1.33
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.35■■□□□ 1.33
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.33■■□□□ 1.33
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.33■■□□□ 1.33
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXD1Q16676 465 aa23.32■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PREX2Q70Z35 1606 aa23.32■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.31■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.3■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCER2I3L3R5 266 aa23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNH8Q96L42 1107 aa23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANP32CO43423 234 aa23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MBD5Q9P267 1494 aa23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCC2Q92887 1545 aa23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.22■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSPY4P0CV99 314 aa23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSPY10P0CW01 314 aa23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.15■■□□□ 1.3
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PKD2Q13563 968 aa23.13■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.12■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUP155O75694 1391 aa23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.1■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.08■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLXNC1O60486 1568 aa23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC7Q96M83 1385 aa23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UNC13BO14795 1591 aa23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDM5CP41229 1560 aa22.99■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLCH2O75038 1416 aa22.98■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.97■■□□□ 1.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.95■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCC1P33527 1531 aa22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.94■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OSCARQ8IYS5 282 aa22.92■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP47Q96K76 1375 aa22.92■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERBINQ96RT1 1412 aa22.89■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.83■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLA2R1Q13018 1463 aa22.82■■□□□ 1.24
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