RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580991.1

IFT20-211, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 4

Gene IFT20, Length 554 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-211ENST00000580991 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.84■■□□□ 1.57
IFT20-211ENST00000580991 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.83■■□□□ 1.57
IFT20-211ENST00000580991 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.82■■□□□ 1.56
IFT20-211ENST00000580991 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.82■■□□□ 1.56
IFT20-211ENST00000580991 ATP10AO60312 1499 aa24.81■■□□□ 1.56
IFT20-211ENST00000580991 PLCH2O75038 1416 aa24.8■■□□□ 1.56
IFT20-211ENST00000580991 SOCS7O14512 581 aa24.79■■□□□ 1.56
IFT20-211ENST00000580991 ILDR2Q71H61 639 aa24.79■■□□□ 1.56
IFT20-211ENST00000580991 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.78■■□□□ 1.56
IFT20-211ENST00000580991 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
IFT20-211ENST00000580991 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
IFT20-211ENST00000580991 STRCQ7RTU9 1775 aa24.74■■□□□ 1.55
IFT20-211ENST00000580991 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
IFT20-211ENST00000580991 EEA1Q15075 1411 aa24.72■■□□□ 1.55
IFT20-211ENST00000580991 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.72■■□□□ 1.55
IFT20-211ENST00000580991 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.71■■□□□ 1.55
IFT20-211ENST00000580991 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.68■■□□□ 1.54
IFT20-211ENST00000580991 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.66■■□□□ 1.54
IFT20-211ENST00000580991 PTPRTO14522 1441 aa24.64■■□□□ 1.54
IFT20-211ENST00000580991 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.63■■□□□ 1.53
IFT20-211ENST00000580991 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
IFT20-211ENST00000580991 AFAP1Q8N556 730 aa24.61■■□□□ 1.53
IFT20-211ENST00000580991 KDM5CP41229 1560 aa24.61■■□□□ 1.53
IFT20-211ENST00000580991 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.59■■□□□ 1.53
IFT20-211ENST00000580991 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
IFT20-211ENST00000580991 REREQ9P2R6 1566 aa24.58■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.57■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 FMN1Q68DA7 1419 aa24.57■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.56■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 KIF14Q15058 1648 aa24.56■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 C3P01024 1663 aa24.56■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.54■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.53■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.52■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
IFT20-211ENST00000580991 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.51■■□□□ 1.51
IFT20-211ENST00000580991 CLIP1P30622 1438 aa24.5■■□□□ 1.51
IFT20-211ENST00000580991 AGLP35573 1532 aa24.5■■□□□ 1.51
IFT20-211ENST00000580991 ABCA6Q8N139 1617 aa24.5■■□□□ 1.51
IFT20-211ENST00000580991 NCOA1Q15788 1441 aa24.48■■□□□ 1.51
IFT20-211ENST00000580991 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.45■■□□□ 1.51
IFT20-211ENST00000580991 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.44■■□□□ 1.5
IFT20-211ENST00000580991 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.43■■□□□ 1.5
IFT20-211ENST00000580991 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
IFT20-211ENST00000580991 ABCC1P33527 1531 aa24.4■■□□□ 1.5
IFT20-211ENST00000580991 NPATQ14207 1427 aa24.38■■□□□ 1.49
IFT20-211ENST00000580991 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.38■■□□□ 1.49
IFT20-211ENST00000580991 PREX2Q70Z35 1606 aa24.38■■□□□ 1.49
IFT20-211ENST00000580991 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.37■■□□□ 1.49
IFT20-211ENST00000580991 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.37■■□□□ 1.49
IFT20-211ENST00000580991 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.36■■□□□ 1.49
IFT20-211ENST00000580991 MROH2AA6NES4 1674 aa24.34■■□□□ 1.49
IFT20-211ENST00000580991 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.34■■□□□ 1.49
IFT20-211ENST00000580991 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.33■■□□□ 1.49
IFT20-211ENST00000580991 ZMYM3Q14202 1370 aa24.32■■□□□ 1.48
IFT20-211ENST00000580991 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
IFT20-211ENST00000580991 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.3■■□□□ 1.48
IFT20-211ENST00000580991 PKD2Q13563 968 aa24.28■■□□□ 1.48
IFT20-211ENST00000580991 PLA2R1Q13018 1463 aa24.26■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.26■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.26■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.26■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.21■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.21■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
IFT20-211ENST00000580991 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
IFT20-211ENST00000580991 PTPRKQ15262 1439 aa24.18■■□□□ 1.46
IFT20-211ENST00000580991 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.18■■□□□ 1.46
IFT20-211ENST00000580991 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.17■■□□□ 1.46
IFT20-211ENST00000580991 ATP7AQ04656 1500 aa24.16■■□□□ 1.46
IFT20-211ENST00000580991 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
IFT20-211ENST00000580991 PLXNC1O60486 1568 aa24.16■■□□□ 1.46
IFT20-211ENST00000580991 A2MP01023 1474 aa24.14■■□□□ 1.46
IFT20-211ENST00000580991 GGT6Q6P531 493 aa24.13■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.12■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.11■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 HSPA1LP34931 641 aa24.1■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.08■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.08■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 TOM1O60784 492 aa24.08■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
IFT20-211ENST00000580991 PIP4K2BP78356 416 aa24.07■■□□□ 1.44
IFT20-211ENST00000580991 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
IFT20-211ENST00000580991 CPS1P31327 1500 aa24.05■■□□□ 1.44
IFT20-211ENST00000580991 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.03■■□□□ 1.44
IFT20-211ENST00000580991 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.02■■□□□ 1.44
IFT20-211ENST00000580991 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
IFT20-211ENST00000580991 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24■■□□□ 1.43
IFT20-211ENST00000580991 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.98■■□□□ 1.43
IFT20-211ENST00000580991 TNRQ92752 1358 aa23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms