RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-211ENST00000575783 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1-211ENST00000575783 HECW1Q76N89 1606 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1-211ENST00000575783 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1-211ENST00000575783 ATP10AO60312 1499 aa27.43■■□□□ 1.98
CTDNEP1-211ENST00000575783 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.42■■□□□ 1.98
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLCH2O75038 1416 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-211ENST00000575783 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-211ENST00000575783 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-211ENST00000575783 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-211ENST00000575783 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-211ENST00000575783 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1-211ENST00000575783 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-211ENST00000575783 AFAP1Q8N556 730 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-211ENST00000575783 STRCQ7RTU9 1775 aa27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1-211ENST00000575783 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1-211ENST00000575783 EEA1Q15075 1411 aa27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTPRTO14522 1441 aa27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1-211ENST00000575783 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-211ENST00000575783 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-211ENST00000575783 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 FMN1Q68DA7 1419 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 KDM5CP41229 1560 aa27.1■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIF14Q15058 1648 aa27.1■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.09■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.09■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLIP1P30622 1438 aa27.07■■□□□ 1.92
CTDNEP1-211ENST00000575783 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-211ENST00000575783 NCOA1Q15788 1441 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-211ENST00000575783 C3P01024 1663 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-211ENST00000575783 REREQ9P2R6 1566 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-211ENST00000575783 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-211ENST00000575783 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABCA6Q8N139 1617 aa27.01■■□□□ 1.92
CTDNEP1-211ENST00000575783 AGLP35573 1532 aa27■■□□□ 1.91
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-211ENST00000575783 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CTDNEP1-211ENST00000575783 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZMYM3Q14202 1370 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-211ENST00000575783 NPATQ14207 1427 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.9■■□□□ 1.9
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CTDNEP1-211ENST00000575783 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-211ENST00000575783 GGT6Q6P531 493 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIP4K2BP78356 416 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-211ENST00000575783 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1-211ENST00000575783 HSPA1LP34931 641 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLA2R1Q13018 1463 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-211ENST00000575783 MROH2AA6NES4 1674 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTPRKQ15262 1439 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-211ENST00000575783 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-211ENST00000575783 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-211ENST00000575783 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.7■■□□□ 1.87
CTDNEP1-211ENST00000575783 TOM1O60784 492 aa26.69■■□□□ 1.86
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CTDNEP1-211ENST00000575783 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-211ENST00000575783 A2MP01023 1474 aa26.68■■□□□ 1.86
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CTDNEP1-211ENST00000575783 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.68■■□□□ 1.86
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-211ENST00000575783 ATP7AQ04656 1500 aa26.65■■□□□ 1.86
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CTDNEP1-211ENST00000575783 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CTDNEP1-211ENST00000575783 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLXNC1O60486 1568 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-211ENST00000575783 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-211ENST00000575783 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-211ENST00000575783 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-211ENST00000575783 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-211ENST00000575783 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.53■■□□□ 1.84
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