RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.12■■■□□ 2.89
EHD4-202ENST00000569223 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.12■■■□□ 2.89
EHD4-202ENST00000569223 TRIM52Q96A61 297 aa33.09■■■□□ 2.89
EHD4-202ENST00000569223 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
EHD4-202ENST00000569223 KIF14Q15058 1648 aa33.08■■■□□ 2.89
EHD4-202ENST00000569223 ABCA8O94911 1581 aa33.06■■■□□ 2.88
EHD4-202ENST00000569223 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.03■■■□□ 2.88
EHD4-202ENST00000569223 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
EHD4-202ENST00000569223 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
EHD4-202ENST00000569223 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.01■■■□□ 2.87
EHD4-202ENST00000569223 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
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EHD4-202ENST00000569223 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
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EHD4-202ENST00000569223 ATP10BO94823 1461 aa32.91■■■□□ 2.86
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EHD4-202ENST00000569223 CHD1O14646 1710 aa32.87■■■□□ 2.85
EHD4-202ENST00000569223 ADGRL2O95490 1459 aa32.86■■■□□ 2.85
EHD4-202ENST00000569223 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.86■■■□□ 2.85
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EHD4-202ENST00000569223 FOXD1Q16676 465 aa32.84■■■□□ 2.85
EHD4-202ENST00000569223 KCNH8Q96L42 1107 aa32.84■■■□□ 2.85
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.84■■■□□ 2.85
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EHD4-202ENST00000569223 PZPP20742 1482 aa32.77■■■□□ 2.84
EHD4-202ENST00000569223 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.74■■■□□ 2.83
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EHD4-202ENST00000569223 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.72■■■□□ 2.83
EHD4-202ENST00000569223 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.71■■■□□ 2.83
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EHD4-202ENST00000569223 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.62■■■□□ 2.81
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EHD4-202ENST00000569223 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.6■■■□□ 2.81
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EHD4-202ENST00000569223 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.54■■■□□ 2.8
EHD4-202ENST00000569223 MBD5Q9P267 1494 aa32.52■■■□□ 2.8
EHD4-202ENST00000569223 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.52■■■□□ 2.8
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EHD4-202ENST00000569223 TSPY4P0CV99 314 aa32.5■■■□□ 2.79
EHD4-202ENST00000569223 TSPY10P0CW01 314 aa32.5■■■□□ 2.79
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EHD4-202ENST00000569223 CCDC7Q96M83 1385 aa32.4■■■□□ 2.78
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EHD4-202ENST00000569223 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.36■■■□□ 2.77
EHD4-202ENST00000569223 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.36■■■□□ 2.77
EHD4-202ENST00000569223 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.35■■■□□ 2.77
EHD4-202ENST00000569223 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
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EHD4-202ENST00000569223 ABCC1P33527 1531 aa32.07■■■□□ 2.73
EHD4-202ENST00000569223 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.04■■■□□ 2.72
EHD4-202ENST00000569223 CCDC184Q52MB2 194 aa32.04■■■□□ 2.72
EHD4-202ENST00000569223 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.04■■■□□ 2.72
EHD4-202ENST00000569223 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.02■■■□□ 2.72
EHD4-202ENST00000569223 FKBP8Q14318 412 aa32.02■■■□□ 2.72
EHD4-202ENST00000569223 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.02■■■□□ 2.72
EHD4-202ENST00000569223 ERBINQ96RT1 1412 aa32.02■■■□□ 2.72
EHD4-202ENST00000569223 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
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