RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569112.5

KIFC3-232, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 4

Gene KIFC3, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-232ENST00000569112 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.96■■□□□ 1.75
KIFC3-232ENST00000569112 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.95■■□□□ 1.75
KIFC3-232ENST00000569112 STRCQ7RTU9 1775 aa25.95■■□□□ 1.75
KIFC3-232ENST00000569112 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.94■■□□□ 1.74
KIFC3-232ENST00000569112 SOCS7O14512 581 aa25.93■■□□□ 1.74
KIFC3-232ENST00000569112 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.93■■□□□ 1.74
KIFC3-232ENST00000569112 PLCH2O75038 1416 aa25.91■■□□□ 1.74
KIFC3-232ENST00000569112 ATP10AO60312 1499 aa25.9■■□□□ 1.74
KIFC3-232ENST00000569112 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
KIFC3-232ENST00000569112 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.87■■□□□ 1.73
KIFC3-232ENST00000569112 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.82■■□□□ 1.72
KIFC3-232ENST00000569112 AFAP1Q8N556 730 aa25.79■■□□□ 1.72
KIFC3-232ENST00000569112 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.76■■□□□ 1.71
KIFC3-232ENST00000569112 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.75■■□□□ 1.71
KIFC3-232ENST00000569112 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.74■■□□□ 1.71
KIFC3-232ENST00000569112 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
KIFC3-232ENST00000569112 PTPRTO14522 1441 aa25.72■■□□□ 1.71
KIFC3-232ENST00000569112 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.72■■□□□ 1.71
KIFC3-232ENST00000569112 KIF14Q15058 1648 aa25.7■■□□□ 1.71
KIFC3-232ENST00000569112 KDM5CP41229 1560 aa25.7■■□□□ 1.71
KIFC3-232ENST00000569112 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.69■■□□□ 1.7
KIFC3-232ENST00000569112 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.68■■□□□ 1.7
KIFC3-232ENST00000569112 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.68■■□□□ 1.7
KIFC3-232ENST00000569112 C3P01024 1663 aa25.68■■□□□ 1.7
KIFC3-232ENST00000569112 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.66■■□□□ 1.7
KIFC3-232ENST00000569112 EEA1Q15075 1411 aa25.64■■□□□ 1.7
KIFC3-232ENST00000569112 ABCA6Q8N139 1617 aa25.63■■□□□ 1.69
KIFC3-232ENST00000569112 REREQ9P2R6 1566 aa25.62■■□□□ 1.69
KIFC3-232ENST00000569112 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
KIFC3-232ENST00000569112 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.6■■□□□ 1.69
KIFC3-232ENST00000569112 NCOA1Q15788 1441 aa25.59■■□□□ 1.69
KIFC3-232ENST00000569112 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.59■■□□□ 1.69
KIFC3-232ENST00000569112 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.58■■□□□ 1.68
KIFC3-232ENST00000569112 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
KIFC3-232ENST00000569112 AGLP35573 1532 aa25.57■■□□□ 1.68
KIFC3-232ENST00000569112 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.57■■□□□ 1.68
KIFC3-232ENST00000569112 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.57■■□□□ 1.68
KIFC3-232ENST00000569112 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.56■■□□□ 1.68
KIFC3-232ENST00000569112 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.54■■□□□ 1.68
KIFC3-232ENST00000569112 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.52■■□□□ 1.68
KIFC3-232ENST00000569112 FMN1Q68DA7 1419 aa25.52■■□□□ 1.68
KIFC3-232ENST00000569112 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
KIFC3-232ENST00000569112 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.5■■□□□ 1.67
KIFC3-232ENST00000569112 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.49■■□□□ 1.67
KIFC3-232ENST00000569112 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.48■■□□□ 1.67
KIFC3-232ENST00000569112 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
KIFC3-232ENST00000569112 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.47■■□□□ 1.67
KIFC3-232ENST00000569112 ABCC1P33527 1531 aa25.47■■□□□ 1.67
KIFC3-232ENST00000569112 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.43■■□□□ 1.66
KIFC3-232ENST00000569112 ZMYM3Q14202 1370 aa25.43■■□□□ 1.66
KIFC3-232ENST00000569112 PREX2Q70Z35 1606 aa25.41■■□□□ 1.66
KIFC3-232ENST00000569112 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.41■■□□□ 1.66
KIFC3-232ENST00000569112 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
KIFC3-232ENST00000569112 NPATQ14207 1427 aa25.4■■□□□ 1.66
KIFC3-232ENST00000569112 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
KIFC3-232ENST00000569112 CLIP1P30622 1438 aa25.39■■□□□ 1.66
KIFC3-232ENST00000569112 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.39■■□□□ 1.66
KIFC3-232ENST00000569112 MROH2AA6NES4 1674 aa25.36■■□□□ 1.65
KIFC3-232ENST00000569112 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.35■■□□□ 1.65
KIFC3-232ENST00000569112 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.34■■□□□ 1.65
KIFC3-232ENST00000569112 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
KIFC3-232ENST00000569112 PTPRKQ15262 1439 aa25.31■■□□□ 1.64
KIFC3-232ENST00000569112 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
KIFC3-232ENST00000569112 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
KIFC3-232ENST00000569112 PLA2R1Q13018 1463 aa25.28■■□□□ 1.64
KIFC3-232ENST00000569112 PKD2Q13563 968 aa25.28■■□□□ 1.64
KIFC3-232ENST00000569112 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
KIFC3-232ENST00000569112 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.27■■□□□ 1.64
KIFC3-232ENST00000569112 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
KIFC3-232ENST00000569112 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.26■■□□□ 1.63
KIFC3-232ENST00000569112 HSPA1LP34931 641 aa25.25■■□□□ 1.63
KIFC3-232ENST00000569112 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
KIFC3-232ENST00000569112 PLXNC1O60486 1568 aa25.24■■□□□ 1.63
KIFC3-232ENST00000569112 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
KIFC3-232ENST00000569112 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.24■■□□□ 1.63
KIFC3-232ENST00000569112 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
KIFC3-232ENST00000569112 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
KIFC3-232ENST00000569112 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.19■■□□□ 1.62
KIFC3-232ENST00000569112 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.19■■□□□ 1.62
KIFC3-232ENST00000569112 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
KIFC3-232ENST00000569112 ATP7AQ04656 1500 aa25.18■■□□□ 1.62
KIFC3-232ENST00000569112 A2MP01023 1474 aa25.18■■□□□ 1.62
KIFC3-232ENST00000569112 GGT6Q6P531 493 aa25.18■■□□□ 1.62
KIFC3-232ENST00000569112 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
KIFC3-232ENST00000569112 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
KIFC3-232ENST00000569112 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.15■■□□□ 1.62
KIFC3-232ENST00000569112 ALKQ9UM73 1620 aa25.14■■□□□ 1.61
KIFC3-232ENST00000569112 PIP4K2BP78356 416 aa25.13■■□□□ 1.61
KIFC3-232ENST00000569112 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.13■■□□□ 1.61
KIFC3-232ENST00000569112 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.12■■□□□ 1.61
KIFC3-232ENST00000569112 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
KIFC3-232ENST00000569112 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
KIFC3-232ENST00000569112 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.08■■□□□ 1.6
KIFC3-232ENST00000569112 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
KIFC3-232ENST00000569112 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
KIFC3-232ENST00000569112 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.05■■□□□ 1.6
KIFC3-232ENST00000569112 TOM1O60784 492 aa25.04■■□□□ 1.6
KIFC3-232ENST00000569112 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.04■■□□□ 1.6
KIFC3-232ENST00000569112 MBD5Q9P267 1494 aa25.03■■□□□ 1.6
KIFC3-232ENST00000569112 CPS1P31327 1500 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms