RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 ILDR2Q71H61 639 aa32.61■■■□□ 2.81
SEMA4B-211ENST00000559322 SOCS7O14512 581 aa32.59■■■□□ 2.81
SEMA4B-211ENST00000559322 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.59■■■□□ 2.81
SEMA4B-211ENST00000559322 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.57■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.57■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.55■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP10AO60312 1499 aa32.54■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.52■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 PLCH2O75038 1416 aa32.51■■■□□ 2.79
SEMA4B-211ENST00000559322 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
SEMA4B-211ENST00000559322 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.45■■■□□ 2.79
SEMA4B-211ENST00000559322 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.43■■■□□ 2.78
SEMA4B-211ENST00000559322 STRCQ7RTU9 1775 aa32.42■■■□□ 2.78
SEMA4B-211ENST00000559322 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.39■■■□□ 2.78
SEMA4B-211ENST00000559322 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.38■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 EEA1Q15075 1411 aa32.36■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.34■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.34■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPRTO14522 1441 aa32.31■■■□□ 2.76
SEMA4B-211ENST00000559322 AFAP1Q8N556 730 aa32.29■■■□□ 2.76
SEMA4B-211ENST00000559322 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
SEMA4B-211ENST00000559322 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.26■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 KDM5CP41229 1560 aa32.24■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF14Q15058 1648 aa32.22■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.21■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 C3P01024 1663 aa32.2■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 FMN1Q68DA7 1419 aa32.19■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 REREQ9P2R6 1566 aa32.18■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.17■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.17■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.16■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 CLIP1P30622 1438 aa32.15■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCA6Q8N139 1617 aa32.13■■■□□ 2.73
SEMA4B-211ENST00000559322 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.12■■■□□ 2.73
SEMA4B-211ENST00000559322 NCOA1Q15788 1441 aa32.11■■■□□ 2.73
SEMA4B-211ENST00000559322 AGLP35573 1532 aa32.1■■■□□ 2.73
SEMA4B-211ENST00000559322 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
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SEMA4B-211ENST00000559322 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.06■■■□□ 2.72
SEMA4B-211ENST00000559322 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.01■■■□□ 2.72
SEMA4B-211ENST00000559322 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.99■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCC1P33527 1531 aa31.99■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 NPATQ14207 1427 aa31.96■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 PREX2Q70Z35 1606 aa31.95■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.95■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.95■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.91■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 ZMYM3Q14202 1370 aa31.91■■■□□ 2.7
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SEMA4B-211ENST00000559322 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.89■■■□□ 2.7
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SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
SEMA4B-211ENST00000559322 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.81■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 PLA2R1Q13018 1463 aa31.8■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.8■■■□□ 2.68
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SEMA4B-211ENST00000559322 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.78■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.77■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.75■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.73■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.72■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.71■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPRKQ15262 1439 aa31.71■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 GGT6Q6P531 493 aa31.7■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 PIP4K2BP78356 416 aa31.68■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP7AQ04656 1500 aa31.68■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 A2MP01023 1474 aa31.67■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 HSPA1LP34931 641 aa31.67■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 PLXNC1O60486 1568 aa31.64■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 TOM1O60784 492 aa31.63■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
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SEMA4B-211ENST00000559322 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.59■■■□□ 2.65
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SEMA4B-211ENST00000559322 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.58■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 CPS1P31327 1500 aa31.55■■■□□ 2.64
SEMA4B-211ENST00000559322 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.55■■■□□ 2.64
SEMA4B-211ENST00000559322 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
SEMA4B-211ENST00000559322 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
SEMA4B-211ENST00000559322 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.51■■■□□ 2.63
SEMA4B-211ENST00000559322 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.5■■■□□ 2.63
SEMA4B-211ENST00000559322 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.49■■■□□ 2.63
SEMA4B-211ENST00000559322 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
SEMA4B-211ENST00000559322 TNRQ92752 1358 aa31.44■■■□□ 2.62
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