RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558352.5

MFGE8-207, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 1,031 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-207ENST00000558352 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.71■■■□□ 2.19
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MFGE8-207ENST00000558352 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.68■■■□□ 2.18
MFGE8-207ENST00000558352 PLCH2O75038 1416 aa28.66■■■□□ 2.18
MFGE8-207ENST00000558352 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.66■■■□□ 2.18
MFGE8-207ENST00000558352 HECW1Q76N89 1606 aa28.65■■■□□ 2.18
MFGE8-207ENST00000558352 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.65■■■□□ 2.18
MFGE8-207ENST00000558352 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.65■■■□□ 2.18
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MFGE8-207ENST00000558352 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
MFGE8-207ENST00000558352 ATP10AO60312 1499 aa28.63■■■□□ 2.17
MFGE8-207ENST00000558352 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.62■■■□□ 2.17
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MFGE8-207ENST00000558352 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.6■■■□□ 2.17
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MFGE8-207ENST00000558352 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.52■■■□□ 2.16
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MFGE8-207ENST00000558352 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.42■■■□□ 2.14
MFGE8-207ENST00000558352 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.41■■■□□ 2.14
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MFGE8-207ENST00000558352 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.35■■■□□ 2.13
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MFGE8-207ENST00000558352 KDM5CP41229 1560 aa28.3■■■□□ 2.12
MFGE8-207ENST00000558352 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.3■■■□□ 2.12
MFGE8-207ENST00000558352 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.27■■■□□ 2.12
MFGE8-207ENST00000558352 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.27■■■□□ 2.12
MFGE8-207ENST00000558352 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.26■■■□□ 2.11
MFGE8-207ENST00000558352 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
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MFGE8-207ENST00000558352 AGLP35573 1532 aa28.2■■■□□ 2.1
MFGE8-207ENST00000558352 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.2■■■□□ 2.1
MFGE8-207ENST00000558352 NCOA1Q15788 1441 aa28.19■■■□□ 2.1
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MFGE8-207ENST00000558352 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.17■■■□□ 2.1
MFGE8-207ENST00000558352 C3P01024 1663 aa28.16■■■□□ 2.1
MFGE8-207ENST00000558352 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.16■■■□□ 2.1
MFGE8-207ENST00000558352 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.15■■■□□ 2.1
MFGE8-207ENST00000558352 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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MFGE8-207ENST00000558352 CEP162Q5TB80 1403 aa28.1■■■□□ 2.09
MFGE8-207ENST00000558352 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
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MFGE8-207ENST00000558352 A2MP01023 1474 aa27.88■■■□□ 2.05
MFGE8-207ENST00000558352 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.87■■■□□ 2.05
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MFGE8-207ENST00000558352 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.82■■■□□ 2.04
MFGE8-207ENST00000558352 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
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MFGE8-207ENST00000558352 TOM1O60784 492 aa27.8■■■□□ 2.04
MFGE8-207ENST00000558352 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.78■■■□□ 2.04
MFGE8-207ENST00000558352 PLXNC1O60486 1568 aa27.77■■■□□ 2.04
MFGE8-207ENST00000558352 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
MFGE8-207ENST00000558352 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
MFGE8-207ENST00000558352 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.75■■■□□ 2.03
MFGE8-207ENST00000558352 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
MFGE8-207ENST00000558352 TIAM1Q13009 1591 aa27.73■■■□□ 2.03
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