RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 MCCP23508 829 aa10.92□□□□□ -0.66
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PTPRB-208ENST00000550358 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-208ENST00000550358 WWC1Q8IX03 1113 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-208ENST00000550358 NBR1Q14596 966 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-208ENST00000550358 AAMPQ13685 434 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-208ENST00000550358 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-208ENST00000550358 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-208ENST00000550358 STK26Q9P289 416 aa10.69□□□□□ -0.7
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PTPRB-208ENST00000550358 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.69□□□□□ -0.7
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