RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537317.1

GOLGA3-205, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-205ENST00000537317 ILDR2Q71H61 639 aa25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3-205ENST00000537317 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3-205ENST00000537317 PLCH2O75038 1416 aa25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3-205ENST00000537317 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
GOLGA3-205ENST00000537317 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.98■■□□□ 1.59
GOLGA3-205ENST00000537317 ATP10AO60312 1499 aa24.98■■□□□ 1.59
GOLGA3-205ENST00000537317 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.96■■□□□ 1.59
GOLGA3-205ENST00000537317 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3-205ENST00000537317 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3-205ENST00000537317 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3-205ENST00000537317 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3-205ENST00000537317 EEA1Q15075 1411 aa24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3-205ENST00000537317 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
GOLGA3-205ENST00000537317 SOCS7O14512 581 aa24.89■■□□□ 1.58
GOLGA3-205ENST00000537317 STRCQ7RTU9 1775 aa24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3-205ENST00000537317 AFAP1Q8N556 730 aa24.88■■□□□ 1.57
GOLGA3-205ENST00000537317 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.85■■□□□ 1.57
GOLGA3-205ENST00000537317 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3-205ENST00000537317 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3-205ENST00000537317 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.8■■□□□ 1.56
GOLGA3-205ENST00000537317 KIF14Q15058 1648 aa24.79■■□□□ 1.56
GOLGA3-205ENST00000537317 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.79■■□□□ 1.56
GOLGA3-205ENST00000537317 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
GOLGA3-205ENST00000537317 KDM5CP41229 1560 aa24.76■■□□□ 1.55
GOLGA3-205ENST00000537317 PTPRTO14522 1441 aa24.76■■□□□ 1.55
GOLGA3-205ENST00000537317 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.76■■□□□ 1.55
GOLGA3-205ENST00000537317 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.75■■□□□ 1.55
GOLGA3-205ENST00000537317 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GOLGA3-205ENST00000537317 FMN1Q68DA7 1419 aa24.74■■□□□ 1.55
GOLGA3-205ENST00000537317 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GOLGA3-205ENST00000537317 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GOLGA3-205ENST00000537317 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.7■■□□□ 1.55
GOLGA3-205ENST00000537317 C3P01024 1663 aa24.7■■□□□ 1.54
GOLGA3-205ENST00000537317 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
GOLGA3-205ENST00000537317 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.7■■□□□ 1.54
GOLGA3-205ENST00000537317 REREQ9P2R6 1566 aa24.7■■□□□ 1.54
GOLGA3-205ENST00000537317 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3-205ENST00000537317 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3-205ENST00000537317 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3-205ENST00000537317 ABCA6Q8N139 1617 aa24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3-205ENST00000537317 CLIP1P30622 1438 aa24.65■■□□□ 1.54
GOLGA3-205ENST00000537317 AGLP35573 1532 aa24.64■■□□□ 1.53
GOLGA3-205ENST00000537317 NCOA1Q15788 1441 aa24.63■■□□□ 1.53
GOLGA3-205ENST00000537317 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.62■■□□□ 1.53
GOLGA3-205ENST00000537317 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.58■■□□□ 1.53
GOLGA3-205ENST00000537317 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.58■■□□□ 1.53
GOLGA3-205ENST00000537317 ABCC1P33527 1531 aa24.58■■□□□ 1.53
GOLGA3-205ENST00000537317 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.56■■□□□ 1.52
GOLGA3-205ENST00000537317 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.56■■□□□ 1.52
GOLGA3-205ENST00000537317 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.54■■□□□ 1.52
GOLGA3-205ENST00000537317 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.54■■□□□ 1.52
GOLGA3-205ENST00000537317 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GOLGA3-205ENST00000537317 PREX2Q70Z35 1606 aa24.53■■□□□ 1.52
GOLGA3-205ENST00000537317 ZMYM3Q14202 1370 aa24.53■■□□□ 1.52
GOLGA3-205ENST00000537317 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.53■■□□□ 1.52
GOLGA3-205ENST00000537317 NPATQ14207 1427 aa24.51■■□□□ 1.51
GOLGA3-205ENST00000537317 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.5■■□□□ 1.51
GOLGA3-205ENST00000537317 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
GOLGA3-205ENST00000537317 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.46■■□□□ 1.51
GOLGA3-205ENST00000537317 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.55e-8■■■■□ 21.8
GOLGA3-205ENST00000537317 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GOLGA3-205ENST00000537317 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.44■■□□□ 1.5
GOLGA3-205ENST00000537317 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.43■■□□□ 1.5
GOLGA3-205ENST00000537317 MROH2AA6NES4 1674 aa24.43■■□□□ 1.5
GOLGA3-205ENST00000537317 PKD2Q13563 968 aa24.42■■□□□ 1.5
GOLGA3-205ENST00000537317 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.42■■□□□ 1.5
GOLGA3-205ENST00000537317 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3-205ENST00000537317 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 PTPRKQ15262 1439 aa24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 GGT6Q6P531 493 aa24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 PLA2R1Q13018 1463 aa24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 A2MP01023 1474 aa24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 ATP7AQ04656 1500 aa24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3-205ENST00000537317 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3-205ENST00000537317 PLXNC1O60486 1568 aa24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3-205ENST00000537317 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3-205ENST00000537317 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3-205ENST00000537317 HSPA1LP34931 641 aa24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3-205ENST00000537317 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3-205ENST00000537317 PIP4K2BP78356 416 aa24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3-205ENST00000537317 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3-205ENST00000537317 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3-205ENST00000537317 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3-205ENST00000537317 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.24■■□□□ 1.47
GOLGA3-205ENST00000537317 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.24■■□□□ 1.47
GOLGA3-205ENST00000537317 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
GOLGA3-205ENST00000537317 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.22■■□□□ 1.47
GOLGA3-205ENST00000537317 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
GOLGA3-205ENST00000537317 TOM1O60784 492 aa24.21■■□□□ 1.47
GOLGA3-205ENST00000537317 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
GOLGA3-205ENST00000537317 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
GOLGA3-205ENST00000537317 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.17■■□□□ 1.46
GOLGA3-205ENST00000537317 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3-205ENST00000537317 TNRQ92752 1358 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms