RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 TONSLQ96HA7 1378 aa32.42■■■□□ 2.78
KCNS1-202ENST00000537075 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
KCNS1-202ENST00000537075 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.41■■■□□ 2.78
KCNS1-202ENST00000537075 DAPK1P53355 1430 aa32.37■■■□□ 2.77
KCNS1-202ENST00000537075 ATP10BO94823 1461 aa32.36■■■□□ 2.77
KCNS1-202ENST00000537075 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.34■■■□□ 2.77
KCNS1-202ENST00000537075 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
KCNS1-202ENST00000537075 ABCC5O15440 1437 aa32.32■■■□□ 2.76
KCNS1-202ENST00000537075 ABCC2Q92887 1545 aa32.32■■■□□ 2.76
KCNS1-202ENST00000537075 ROCK1Q13464 1354 aa32.31■■■□□ 2.76
KCNS1-202ENST00000537075 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.29■■■□□ 2.76
KCNS1-202ENST00000537075 KIF14Q15058 1648 aa32.29■■■□□ 2.76
KCNS1-202ENST00000537075 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
KCNS1-202ENST00000537075 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
KCNS1-202ENST00000537075 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.23■■■□□ 2.75
KCNS1-202ENST00000537075 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.23■■■□□ 2.75
KCNS1-202ENST00000537075 TRIM52Q96A61 297 aa32.21■■■□□ 2.75
KCNS1-202ENST00000537075 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
KCNS1-202ENST00000537075 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.21■■■□□ 2.75
KCNS1-202ENST00000537075 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
KCNS1-202ENST00000537075 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.18■■■□□ 2.74
KCNS1-202ENST00000537075 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.16■■■□□ 2.74
KCNS1-202ENST00000537075 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.16■■■□□ 2.74
KCNS1-202ENST00000537075 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
KCNS1-202ENST00000537075 KCNH8Q96L42 1107 aa32.12■■■□□ 2.73
KCNS1-202ENST00000537075 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.1■■■□□ 2.73
KCNS1-202ENST00000537075 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
KCNS1-202ENST00000537075 ADGRL2O95490 1459 aa32.06■■■□□ 2.72
KCNS1-202ENST00000537075 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.05■■■□□ 2.72
KCNS1-202ENST00000537075 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.05■■■□□ 2.72
KCNS1-202ENST00000537075 NCOA1Q15788 1441 aa32.04■■■□□ 2.72
KCNS1-202ENST00000537075 FOXD1Q16676 465 aa32.03■■■□□ 2.72
KCNS1-202ENST00000537075 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
KCNS1-202ENST00000537075 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
KCNS1-202ENST00000537075 PZPP20742 1482 aa31.99■■■□□ 2.71
KCNS1-202ENST00000537075 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.96■■■□□ 2.71
KCNS1-202ENST00000537075 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.95■■■□□ 2.71
KCNS1-202ENST00000537075 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
KCNS1-202ENST00000537075 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
KCNS1-202ENST00000537075 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.9■■■□□ 2.7
KCNS1-202ENST00000537075 CCER2I3L3R5 266 aa31.89■■■□□ 2.7
KCNS1-202ENST00000537075 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.7
KCNS1-202ENST00000537075 PREX2Q70Z35 1606 aa31.88■■■□□ 2.69
KCNS1-202ENST00000537075 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
KCNS1-202ENST00000537075 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.88■■■□□ 2.69
KCNS1-202ENST00000537075 ANP32CO43423 234 aa31.87■■■□□ 2.69
KCNS1-202ENST00000537075 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.87■■■□□ 2.69
KCNS1-202ENST00000537075 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.87■■■□□ 2.69
KCNS1-202ENST00000537075 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.84■■■□□ 2.69
KCNS1-202ENST00000537075 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.81■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.81■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.8■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.8■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.8■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.8■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.8■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.8■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.79■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.79■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.78■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.76■■■□□ 2.68
KCNS1-202ENST00000537075 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.75■■■□□ 2.67
KCNS1-202ENST00000537075 MBD5Q9P267 1494 aa31.74■■■□□ 2.67
KCNS1-202ENST00000537075 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.72■■■□□ 2.67
KCNS1-202ENST00000537075 ASXL2Q76L83 1435 aa31.72■■■□□ 2.67
KCNS1-202ENST00000537075 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
KCNS1-202ENST00000537075 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.72■■■□□ 2.67
KCNS1-202ENST00000537075 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
KCNS1-202ENST00000537075 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.68■■■□□ 2.66
KCNS1-202ENST00000537075 PLCH2O75038 1416 aa31.67■■■□□ 2.66
KCNS1-202ENST00000537075 PKD2Q13563 968 aa31.66■■■□□ 2.66
KCNS1-202ENST00000537075 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.65■■■□□ 2.66
KCNS1-202ENST00000537075 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.65■■■□□ 2.66
KCNS1-202ENST00000537075 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.64■■■□□ 2.66
KCNS1-202ENST00000537075 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.63■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 CCDC7Q96M83 1385 aa31.62■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 KIF15Q9NS87 1388 aa31.62■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 TSPY4P0CV99 314 aa31.61■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 TSPY10P0CW01 314 aa31.61■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.61■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.61■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 NUP155O75694 1391 aa31.6■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.59■■■□□ 2.65
KCNS1-202ENST00000537075 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.57■■■□□ 2.64
KCNS1-202ENST00000537075 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.56■■■□□ 2.64
KCNS1-202ENST00000537075 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.55■■■□□ 2.64
KCNS1-202ENST00000537075 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.55■■■□□ 2.64
KCNS1-202ENST00000537075 ABCC1P33527 1531 aa31.49■■■□□ 2.63
KCNS1-202ENST00000537075 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.48■■■□□ 2.63
KCNS1-202ENST00000537075 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.48■■■□□ 2.63
KCNS1-202ENST00000537075 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.47■■■□□ 2.63
KCNS1-202ENST00000537075 KDM5CP41229 1560 aa31.47■■■□□ 2.63
KCNS1-202ENST00000537075 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.46■■■□□ 2.63
KCNS1-202ENST00000537075 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.46■■■□□ 2.63
KCNS1-202ENST00000537075 UNC13BO14795 1591 aa31.45■■■□□ 2.62
KCNS1-202ENST00000537075 PLXNC1O60486 1568 aa31.44■■■□□ 2.62
KCNS1-202ENST00000537075 FANCAO15360 1455 aa31.44■■■□□ 2.62
KCNS1-202ENST00000537075 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.42■■■□□ 2.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP47Q96K76 1375 aa31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms