RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529896.1

SLC43A3-216, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SLC43A3, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-216ENST00000529896 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC43A3-216ENST00000529896 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 ATP10AO60312 1499 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 PLCH2O75038 1416 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 EEA1Q15075 1411 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 SOCS7O14512 581 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC43A3-216ENST00000529896 ILDR2Q71H61 639 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC43A3-216ENST00000529896 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC43A3-216ENST00000529896 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SLC43A3-216ENST00000529896 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SLC43A3-216ENST00000529896 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SLC43A3-216ENST00000529896 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC43A3-216ENST00000529896 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3-216ENST00000529896 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3-216ENST00000529896 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3-216ENST00000529896 STRCQ7RTU9 1775 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3-216ENST00000529896 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3-216ENST00000529896 AFAP1Q8N556 730 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3-216ENST00000529896 PTPRTO14522 1441 aa22.46■■□□□ 1.19
SLC43A3-216ENST00000529896 FMN1Q68DA7 1419 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC43A3-216ENST00000529896 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.43■■□□□ 1.18
SLC43A3-216ENST00000529896 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC43A3-216ENST00000529896 CLIP1P30622 1438 aa22.4■■□□□ 1.18
SLC43A3-216ENST00000529896 KIF14Q15058 1648 aa22.4■■□□□ 1.18
SLC43A3-216ENST00000529896 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SLC43A3-216ENST00000529896 KDM5CP41229 1560 aa22.4■■□□□ 1.18
SLC43A3-216ENST00000529896 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SLC43A3-216ENST00000529896 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.38■■□□□ 1.17
SLC43A3-216ENST00000529896 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.38■■□□□ 1.17
SLC43A3-216ENST00000529896 REREQ9P2R6 1566 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC43A3-216ENST00000529896 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC43A3-216ENST00000529896 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC43A3-216ENST00000529896 C3P01024 1663 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC43A3-216ENST00000529896 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC43A3-216ENST00000529896 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC43A3-216ENST00000529896 AGLP35573 1532 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC43A3-216ENST00000529896 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC43A3-216ENST00000529896 ABCA6Q8N139 1617 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC43A3-216ENST00000529896 NCOA1Q15788 1441 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC43A3-216ENST00000529896 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC43A3-216ENST00000529896 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.25■■□□□ 1.15
SLC43A3-216ENST00000529896 NPATQ14207 1427 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3-216ENST00000529896 ABCC1P33527 1531 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3-216ENST00000529896 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3-216ENST00000529896 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3-216ENST00000529896 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3-216ENST00000529896 PREX2Q70Z35 1606 aa22.2■■□□□ 1.15
SLC43A3-216ENST00000529896 ZMYM3Q14202 1370 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 PKD2Q13563 968 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 MROH2AA6NES4 1674 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-216ENST00000529896 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-216ENST00000529896 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-216ENST00000529896 PLA2R1Q13018 1463 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC43A3-216ENST00000529896 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-216ENST00000529896 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-216ENST00000529896 GGT6Q6P531 493 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-216ENST00000529896 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-216ENST00000529896 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 PTPRKQ15262 1439 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 A2MP01023 1474 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 ATP7AQ04656 1500 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC43A3-216ENST00000529896 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 TOM1O60784 492 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 PIP4K2BP78356 416 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 HSPA1LP34931 641 aa21.99■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 PLXNC1O60486 1568 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
SLC43A3-216ENST00000529896 CPS1P31327 1500 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC43A3-216ENST00000529896 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-216ENST00000529896 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-216ENST00000529896 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-216ENST00000529896 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-216ENST00000529896 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-216ENST00000529896 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-216ENST00000529896 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.6 ms