RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525151.5

TRAF3IP2-AS1-208, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AGLP35573 1532 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.83■■■□□ 2.21
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.45■■■□□ 2.14
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.39■■■□□ 2.14
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ATP7AQ04656 1500 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TOM1O60784 492 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 A2MP01023 1474 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GGT6Q6P531 493 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.2■■■□□ 2.11
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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