RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525088.5

RPS6KB2-205, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B2, humanhuman

TSL 2

Gene RPS6KB2, Length 5,528 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2-205ENST00000525088 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB2-205ENST00000525088 CASC1Q6TDU7 716 aa18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB2-205ENST00000525088 NESP48681 1621 aa18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2-205ENST00000525088 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.72■□□□□ 0.59
RPS6KB2-205ENST00000525088 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2-205ENST00000525088 IGF1RP08069 1367 aa18.71■□□□□ 0.59
RPS6KB2-205ENST00000525088 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.7■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 ARID3AQ99856 593 aa18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.68■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 CCER2I3L3R5 266 aa18.68■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 CUX1P39880 1505 aa18.67■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 IFT140Q96RY7 1462 aa18.66■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.66■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.65■□□□□ 0.58
RPS6KB2-205ENST00000525088 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.63■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.63■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 PTPRGP23470 1445 aa18.62■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 NEUROD2Q15784 382 aa18.62■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.62■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.62■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 CFAP53Q96M91 514 aa18.6■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 34.5
RPS6KB2-205ENST00000525088 CDCA8Q53HL2 280 aa18.6■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 GRIN2BQ13224 1484 aa18.59■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.58■□□□□ 0.57
RPS6KB2-205ENST00000525088 NRDCO43847 1150 aa18.58■□□□□ 0.56
RPS6KB2-205ENST00000525088 MLECQ14165 292 aa18.58■□□□□ 0.56
RPS6KB2-205ENST00000525088 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.56■□□□□ 0.56
RPS6KB2-205ENST00000525088 POGKQ9P215 609 aa18.56■□□□□ 0.56
RPS6KB2-205ENST00000525088 HSCBQ8IWL3 235 aa18.55■□□□□ 0.56
RPS6KB2-205ENST00000525088 TOPBP1Q92547 1522 aa18.54■□□□□ 0.56
RPS6KB2-205ENST00000525088 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.54■□□□□ 0.56
RPS6KB2-205ENST00000525088 DRC7Q8IY82 874 aa18.54■□□□□ 0.56
RPS6KB2-205ENST00000525088 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.52■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 FGD1P98174 961 aa18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 KANK1Q14678 1352 aa18.5■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 PRXQ9BXM0 1461 aa18.5■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 KCNJ4P48050 445 aa18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB2-205ENST00000525088 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.46■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 ARAP1Q96P48 1450 aa18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 NUDCQ9Y266 331 aa18.42■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.42■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.41■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 GGT6Q6P531 493 aa18.41■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.4■□□□□ 0.54
RPS6KB2-205ENST00000525088 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.39■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.38■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 PRDM2Q13029 1718 aa18.38■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 SOX12O15370 315 aa18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 TMF1P82094 1093 aa18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 CUL7Q14999 1698 aa18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 PKD2Q13563 968 aa18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
RPS6KB2-205ENST00000525088 MS4A1P11836 297 aa18.33■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.33■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 GBP4Q96PP9 640 aa18.32■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.32■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 FOXD1Q16676 465 aa18.32■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.31■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.31■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.31■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 MCCP23508 829 aa18.31■□□□□ 0.52
RPS6KB2-205ENST00000525088 NUP155O75694 1391 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119 ms