RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.91■■□□□ 1.9
ALYREF-204ENST00000512673 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.91■■□□□ 1.9
ALYREF-204ENST00000512673 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.89
ALYREF-204ENST00000512673 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.87■■□□□ 1.89
ALYREF-204ENST00000512673 SAMD9Q5K651 1589 aa26.87■■□□□ 1.89
ALYREF-204ENST00000512673 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.87■■□□□ 1.89
ALYREF-204ENST00000512673 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.86■■□□□ 1.89
ALYREF-204ENST00000512673 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.85■■□□□ 1.89
ALYREF-204ENST00000512673 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
ALYREF-204ENST00000512673 PTPRTO14522 1441 aa26.82■■□□□ 1.88
ALYREF-204ENST00000512673 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.82■■□□□ 1.88
ALYREF-204ENST00000512673 ATP10AO60312 1499 aa26.81■■□□□ 1.88
ALYREF-204ENST00000512673 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.8■■□□□ 1.88
ALYREF-204ENST00000512673 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ALYREF-204ENST00000512673 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.7■■□□□ 1.87
ALYREF-204ENST00000512673 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.69■■□□□ 1.86
ALYREF-204ENST00000512673 C3P01024 1663 aa26.68■■□□□ 1.86
ALYREF-204ENST00000512673 PLCH2O75038 1416 aa26.65■■□□□ 1.86
ALYREF-204ENST00000512673 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ALYREF-204ENST00000512673 NCOA1Q15788 1441 aa26.64■■□□□ 1.85
ALYREF-204ENST00000512673 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-204ENST00000512673 AFAP1Q8N556 730 aa26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-204ENST00000512673 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.56■■□□□ 1.84
ALYREF-204ENST00000512673 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.56■■□□□ 1.84
ALYREF-204ENST00000512673 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.56■■□□□ 1.84
ALYREF-204ENST00000512673 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.55■■□□□ 1.84
ALYREF-204ENST00000512673 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.55■■□□□ 1.84
ALYREF-204ENST00000512673 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
ALYREF-204ENST00000512673 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ALYREF-204ENST00000512673 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.53■■□□□ 1.84
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.53■■□□□ 1.84
ALYREF-204ENST00000512673 ABCA6Q8N139 1617 aa26.5■■□□□ 1.83
ALYREF-204ENST00000512673 KDM5CP41229 1560 aa26.5■■□□□ 1.83
ALYREF-204ENST00000512673 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ALYREF-204ENST00000512673 HSPA1LP34931 641 aa26.49■■□□□ 1.83
ALYREF-204ENST00000512673 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.48■■□□□ 1.83
ALYREF-204ENST00000512673 KIF14Q15058 1648 aa26.46■■□□□ 1.83
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.45■■□□□ 1.83
ALYREF-204ENST00000512673 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
ALYREF-204ENST00000512673 REREQ9P2R6 1566 aa26.45■■□□□ 1.82
ALYREF-204ENST00000512673 PIP4K2BP78356 416 aa26.44■■□□□ 1.82
ALYREF-204ENST00000512673 AGLP35573 1532 aa26.39■■□□□ 1.82
ALYREF-204ENST00000512673 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-204ENST00000512673 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.36■■□□□ 1.81
ALYREF-204ENST00000512673 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.35■■□□□ 1.81
ALYREF-204ENST00000512673 NPATQ14207 1427 aa26.32■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 ZMYM3Q14202 1370 aa26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 PKD2Q13563 968 aa26.29■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.29■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.28■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.28■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.28■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 MROH2AA6NES4 1674 aa26.27■■□□□ 1.8
ALYREF-204ENST00000512673 PLA2R1Q13018 1463 aa26.26■■□□□ 1.79
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ALYREF-204ENST00000512673 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
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ALYREF-204ENST00000512673 ABCC1P33527 1531 aa26.24■■□□□ 1.79
ALYREF-204ENST00000512673 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ALYREF-204ENST00000512673 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.24■■□□□ 1.79
ALYREF-204ENST00000512673 TOM1O60784 492 aa26.23■■□□□ 1.79
ALYREF-204ENST00000512673 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ALYREF-204ENST00000512673 CLIP1P30622 1438 aa26.18■■□□□ 1.78
ALYREF-204ENST00000512673 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.18■■□□□ 1.78
ALYREF-204ENST00000512673 PTPRKQ15262 1439 aa26.17■■□□□ 1.78
ALYREF-204ENST00000512673 PREX2Q70Z35 1606 aa26.17■■□□□ 1.78
ALYREF-204ENST00000512673 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.15■■□□□ 1.78
ALYREF-204ENST00000512673 FMN1Q68DA7 1419 aa26.13■■□□□ 1.77
ALYREF-204ENST00000512673 ALKQ9UM73 1620 aa26.12■■□□□ 1.77
ALYREF-204ENST00000512673 CPS1P31327 1500 aa26.11■■□□□ 1.77
ALYREF-204ENST00000512673 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.11■■□□□ 1.77
ALYREF-204ENST00000512673 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.11■■□□□ 1.77
ALYREF-204ENST00000512673 GGT6Q6P531 493 aa26.09■■□□□ 1.77
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ALYREF-204ENST00000512673 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.07■■□□□ 1.76
ALYREF-204ENST00000512673 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.06■■□□□ 1.76
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ALYREF-204ENST00000512673 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.04■■□□□ 1.76
ALYREF-204ENST00000512673 EEA1Q15075 1411 aa26.04■■□□□ 1.76
ALYREF-204ENST00000512673 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.03■■□□□ 1.76
ALYREF-204ENST00000512673 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.03■■□□□ 1.76
ALYREF-204ENST00000512673 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
ALYREF-204ENST00000512673 VWDEQ8N2E2 1590 aa26■■□□□ 1.75
ALYREF-204ENST00000512673 PLXNC1O60486 1568 aa25.99■■□□□ 1.75
ALYREF-204ENST00000512673 ATP7AQ04656 1500 aa25.98■■□□□ 1.75
ALYREF-204ENST00000512673 A2MP01023 1474 aa25.98■■□□□ 1.75
ALYREF-204ENST00000512673 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-204ENST00000512673 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ALYREF-204ENST00000512673 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
ALYREF-204ENST00000512673 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
ALYREF-204ENST00000512673 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.89■■□□□ 1.74
ALYREF-204ENST00000512673 TNRQ92752 1358 aa25.89■■□□□ 1.74
ALYREF-204ENST00000512673 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.89■■□□□ 1.73
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