RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.81□□□□□ -0.84
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDR70Q9NW82 654 aa9.79□□□□□ -0.84
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.79□□□□□ -0.84
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.79□□□□□ -0.84
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.78□□□□□ -0.84
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAP3K13O43283 966 aa9.68□□□□□ -0.86
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.68□□□□□ -0.86
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.67□□□□□ -0.86
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.67□□□□□ -0.86
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NLRP6P59044 892 aa9.63□□□□□ -0.87
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARAP1Q96P48 1450 aa9.63□□□□□ -0.87
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITGAEP38570 1179 aa9.62□□□□□ -0.87
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 E2F4Q16254 413 aa9.62□□□□□ -0.87
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRXQ9BXM0 1461 aa9.62□□□□□ -0.87
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.6□□□□□ -0.87
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.55□□□□□ -0.88
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PHF12Q96QT6 1004 aa9.55□□□□□ -0.88
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.55□□□□□ -0.88
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.53□□□□□ -0.88
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.53□□□□□ -0.88
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNH8Q96L42 1107 aa9.51□□□□□ -0.89
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.49□□□□□ -0.89
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GOLGA2Q08379 1002 aa9.49□□□□□ -0.89
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MFSD10Q14728 455 aa9.47□□□□□ -0.89
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.47□□□□□ -0.89
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.47□□□□□ -0.89
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PBRM1Q86U86 1689 aa9.47□□□□□ -0.89
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CUL7Q14999 1698 aa9.46□□□□□ -0.89
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.46□□□□□ -0.89
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NEUROD2Q15784 382 aa9.45□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRIN2BQ13224 1484 aa9.44□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.43□□□□□ -0.9
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