RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496101.5

GCOM1-211, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GCOM1, Length 2,032 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-211ENST00000496101 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.51■■□□□ 1.67
GCOM1-211ENST00000496101 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
GCOM1-211ENST00000496101 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.48■■□□□ 1.67
GCOM1-211ENST00000496101 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
GCOM1-211ENST00000496101 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
GCOM1-211ENST00000496101 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
GCOM1-211ENST00000496101 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.47■■□□□ 1.67
GCOM1-211ENST00000496101 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.45■■□□□ 1.67
GCOM1-211ENST00000496101 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.45■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.44■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.44■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 CEP170Q5SW79 1584 aa25.43■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 NEFLP07196 543 aa25.43■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 FKBP8Q14318 412 aa25.43■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 SYNJ2O15056 1496 aa25.43■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.42■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 NCOA1Q15788 1441 aa25.42■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 ADGRL2O95490 1459 aa25.42■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.41■■□□□ 1.66
GCOM1-211ENST00000496101 ARID3CA6NKF2 412 aa25.39■■□□□ 1.65
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GCOM1-211ENST00000496101 PZPP20742 1482 aa25.36■■□□□ 1.65
GCOM1-211ENST00000496101 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
GCOM1-211ENST00000496101 NUP160Q12769 1436 aa25.35■■□□□ 1.65
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC7Q96M83 1385 aa25.34■■□□□ 1.65
GCOM1-211ENST00000496101 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.34■■□□□ 1.65
GCOM1-211ENST00000496101 KIF14Q15058 1648 aa25.34■■□□□ 1.65
GCOM1-211ENST00000496101 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
GCOM1-211ENST00000496101 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.32■■□□□ 1.64
GCOM1-211ENST00000496101 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.32■■□□□ 1.64
GCOM1-211ENST00000496101 MBD5Q9P267 1494 aa25.3■■□□□ 1.64
GCOM1-211ENST00000496101 FOXD1Q16676 465 aa25.29■■□□□ 1.64
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GCOM1-211ENST00000496101 ERCC6Q03468 1493 aa25.29■■□□□ 1.64
GCOM1-211ENST00000496101 ABCA8O94911 1581 aa25.28■■□□□ 1.64
GCOM1-211ENST00000496101 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
GCOM1-211ENST00000496101 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.27■■□□□ 1.64
GCOM1-211ENST00000496101 BCANQ96GW7 911 aa25.27■■□□□ 1.64
GCOM1-211ENST00000496101 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.26■■□□□ 1.63
GCOM1-211ENST00000496101 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.26■■□□□ 1.63
GCOM1-211ENST00000496101 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
GCOM1-211ENST00000496101 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.25■■□□□ 1.63
GCOM1-211ENST00000496101 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.23■■□□□ 1.63
GCOM1-211ENST00000496101 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
GCOM1-211ENST00000496101 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.21■■□□□ 1.63
GCOM1-211ENST00000496101 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
GCOM1-211ENST00000496101 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
GCOM1-211ENST00000496101 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.19■■□□□ 1.62
GCOM1-211ENST00000496101 JPH4Q96JJ6 628 aa25.17■■□□□ 1.62
GCOM1-211ENST00000496101 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.16■■□□□ 1.62
GCOM1-211ENST00000496101 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.15■■□□□ 1.62
GCOM1-211ENST00000496101 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.13■■□□□ 1.61
GCOM1-211ENST00000496101 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.13■■□□□ 1.61
GCOM1-211ENST00000496101 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.13■■□□□ 1.61
GCOM1-211ENST00000496101 ATP10BO94823 1461 aa25.12■■□□□ 1.61
GCOM1-211ENST00000496101 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.12■■□□□ 1.61
GCOM1-211ENST00000496101 KDM5CP41229 1560 aa25.11■■□□□ 1.61
GCOM1-211ENST00000496101 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.1■■□□□ 1.61
GCOM1-211ENST00000496101 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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GCOM1-211ENST00000496101 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.07■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.07■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.06■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 PKD2Q13563 968 aa25.05■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC184Q52MB2 194 aa25.05■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 PTPRGP23470 1445 aa25.05■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 USP47Q96K76 1375 aa25.05■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 MRS2Q9HD23 443 aa25.03■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 FBLN2P98095 1184 aa25.03■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
GCOM1-211ENST00000496101 PREX2Q70Z35 1606 aa25.01■■□□□ 1.59
GCOM1-211ENST00000496101 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
GCOM1-211ENST00000496101 NUP155O75694 1391 aa24.98■■□□□ 1.59
GCOM1-211ENST00000496101 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
GCOM1-211ENST00000496101 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.96■■□□□ 1.59
GCOM1-211ENST00000496101 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.95■■□□□ 1.59
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.95■■□□□ 1.59
GCOM1-211ENST00000496101 KIF15Q9NS87 1388 aa24.95■■□□□ 1.58
GCOM1-211ENST00000496101 TSPY4P0CV99 314 aa24.95■■□□□ 1.58
GCOM1-211ENST00000496101 TSPY10P0CW01 314 aa24.95■■□□□ 1.58
GCOM1-211ENST00000496101 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.95■■□□□ 1.58
GCOM1-211ENST00000496101 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.94■■□□□ 1.58
GCOM1-211ENST00000496101 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.94■■□□□ 1.58
GCOM1-211ENST00000496101 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.9■■□□□ 1.58
GCOM1-211ENST00000496101 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.9■■□□□ 1.58
GCOM1-211ENST00000496101 UNC13BO14795 1591 aa24.89■■□□□ 1.57
GCOM1-211ENST00000496101 E9PCH4 1651 aa24.88■■□□□ 1.57
GCOM1-211ENST00000496101 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.88■■□□□ 1.57
GCOM1-211ENST00000496101 SHROOM2Q13796 1616 aa24.87■■□□□ 1.57
GCOM1-211ENST00000496101 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GCOM1-211ENST00000496101 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GCOM1-211ENST00000496101 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GCOM1-211ENST00000496101 PLXNC1O60486 1568 aa24.83■■□□□ 1.57
GCOM1-211ENST00000496101 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
GCOM1-211ENST00000496101 CHD1O14646 1710 aa24.82■■□□□ 1.56
GCOM1-211ENST00000496101 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.81■■□□□ 1.56
GCOM1-211ENST00000496101 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
GCOM1-211ENST00000496101 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.81■■□□□ 1.56
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