RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.87□□□□□ -0.671e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-212ENST00000491266 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
RABGGTB-212ENST00000491266 IER5LQ5T953 404 aa10.86□□□□□ -0.67
RABGGTB-212ENST00000491266 SMARCA2P51531 1590 aa10.86□□□□□ -0.67
RABGGTB-212ENST00000491266 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
RABGGTB-212ENST00000491266 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
RABGGTB-212ENST00000491266 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 HMGXB3Q12766 1538 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 MFSD10Q14728 455 aa10.79□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 OCEL1Q9H607 264 aa10.79□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 P3H3Q8IVL6 736 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-212ENST00000491266 WDR70Q9NW82 654 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 POTEIP0CG38 1075 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 PDE4AP27815 886 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 MICALL2Q8IY33 904 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 NBR1Q14596 966 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 POTEFA5A3E0 1075 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC39A7Q92504 469 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 PLCG2P16885 1265 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-212ENST00000491266 E2F4Q16254 413 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 C7P10643 843 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 CAMK2BQ13554 666 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 KIF3CO14782 793 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 LHX8Q68G74 356 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 METRNQ9UJH8 293 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-212ENST00000491266 SEC24BO95487 1268 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-212ENST00000491266 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-212ENST00000491266 FOXK1P85037 733 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGGTB-212ENST00000491266 NESP48681 1621 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGGTB-212ENST00000491266 DSG2Q14126 1118 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTB-212ENST00000491266 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTB-212ENST00000491266 CFTRP13569 1480 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTB-212ENST00000491266 G3V3G9 751 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTB-212ENST00000491266 C2orf72A6NCS6 295 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-212ENST00000491266 TMC2Q8TDI7 906 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-212ENST00000491266 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-212ENST00000491266 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-212ENST00000491266 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-212ENST00000491266 PLPP6Q8IY26 295 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGGTB-212ENST00000491266 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RABGGTB-212ENST00000491266 SEMA3EO15041 775 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGGTB-212ENST00000491266 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
RABGGTB-212ENST00000491266 ABCC8Q09428 1581 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-212ENST00000491266 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-212ENST00000491266 PDIA6Q15084 440 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGGTB-212ENST00000491266 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 DPYSL4O14531 572 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 POTEJP0CG39 1038 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 OXER1Q8TDS5 423 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 POTEB2H3BUK9 544 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 CUX1P39880 1505 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 SYNJ1O43426 1573 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC34A2O95436 690 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-212ENST00000491266 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 MAP3K9P80192 1104 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 TOPBP1Q92547 1522 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-212ENST00000491266 PRDM2Q13029 1718 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 PTGER2P43116 358 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 TOP2BQ02880 1626 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 ERCC6Q03468 1493 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 TBC1D12O60347 775 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 SOGA1O94964 1423 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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