RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488033.5

HCLS1-209, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 4

Gene HCLS1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-209ENST00000488033 HECW1Q76N89 1606 aa22.89■■□□□ 1.25
HCLS1-209ENST00000488033 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-209ENST00000488033 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-209ENST00000488033 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-209ENST00000488033 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-209ENST00000488033 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.83■■□□□ 1.25
HCLS1-209ENST00000488033 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.82■■□□□ 1.24
HCLS1-209ENST00000488033 ATP10AO60312 1499 aa22.81■■□□□ 1.24
HCLS1-209ENST00000488033 STRCQ7RTU9 1775 aa22.81■■□□□ 1.24
HCLS1-209ENST00000488033 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.8■■□□□ 1.24
HCLS1-209ENST00000488033 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-209ENST00000488033 PLCH2O75038 1416 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-209ENST00000488033 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.76■■□□□ 1.23
HCLS1-209ENST00000488033 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HCLS1-209ENST00000488033 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HCLS1-209ENST00000488033 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.72■■□□□ 1.23
HCLS1-209ENST00000488033 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.69■■□□□ 1.22
HCLS1-209ENST00000488033 PTPRTO14522 1441 aa22.68■■□□□ 1.22
HCLS1-209ENST00000488033 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.68■■□□□ 1.22
HCLS1-209ENST00000488033 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HCLS1-209ENST00000488033 AFAP1Q8N556 730 aa22.64■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.64■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 C3P01024 1663 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 EEA1Q15075 1411 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 KDM5CP41229 1560 aa22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.58■■□□□ 1.21
HCLS1-209ENST00000488033 KIF14Q15058 1648 aa22.57■■□□□ 1.2
HCLS1-209ENST00000488033 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.57■■□□□ 1.2
HCLS1-209ENST00000488033 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.56■■□□□ 1.2
HCLS1-209ENST00000488033 REREQ9P2R6 1566 aa22.55■■□□□ 1.2
HCLS1-209ENST00000488033 NCOA1Q15788 1441 aa22.53■■□□□ 1.2
HCLS1-209ENST00000488033 ABCA6Q8N139 1617 aa22.53■■□□□ 1.2
HCLS1-209ENST00000488033 FMN1Q68DA7 1419 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-209ENST00000488033 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-209ENST00000488033 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-209ENST00000488033 AGLP35573 1532 aa22.49■■□□□ 1.19
HCLS1-209ENST00000488033 CLIP1P30622 1438 aa22.48■■□□□ 1.19
HCLS1-209ENST00000488033 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.47■■□□□ 1.19
HCLS1-209ENST00000488033 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.47■■□□□ 1.19
HCLS1-209ENST00000488033 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.46■■□□□ 1.19
HCLS1-209ENST00000488033 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.46■■□□□ 1.19
HCLS1-209ENST00000488033 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-209ENST00000488033 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-209ENST00000488033 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HCLS1-209ENST00000488033 ABCC1P33527 1531 aa22.41■■□□□ 1.18
HCLS1-209ENST00000488033 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-209ENST00000488033 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-209ENST00000488033 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-209ENST00000488033 NPATQ14207 1427 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-209ENST00000488033 PREX2Q70Z35 1606 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-209ENST00000488033 ZMYM3Q14202 1370 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-209ENST00000488033 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.37■■□□□ 1.17
HCLS1-209ENST00000488033 MROH2AA6NES4 1674 aa22.37■■□□□ 1.17
HCLS1-209ENST00000488033 PKD2Q13563 968 aa22.35■■□□□ 1.17
HCLS1-209ENST00000488033 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HCLS1-209ENST00000488033 PLA2R1Q13018 1463 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-209ENST00000488033 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-209ENST00000488033 HSPA1LP34931 641 aa22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-209ENST00000488033 PIP4K2BP78356 416 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-209ENST00000488033 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-209ENST00000488033 PTPRKQ15262 1439 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-209ENST00000488033 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-209ENST00000488033 GGT6Q6P531 493 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-209ENST00000488033 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
HCLS1-209ENST00000488033 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-209ENST00000488033 TOM1O60784 492 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-209ENST00000488033 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-209ENST00000488033 ATP7AQ04656 1500 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-209ENST00000488033 A2MP01023 1474 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-209ENST00000488033 PLXNC1O60486 1568 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-209ENST00000488033 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-209ENST00000488033 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-209ENST00000488033 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-209ENST00000488033 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-209ENST00000488033 CPS1P31327 1500 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-209ENST00000488033 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-209ENST00000488033 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-209ENST00000488033 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-209ENST00000488033 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-209ENST00000488033 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-209ENST00000488033 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-209ENST00000488033 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-209ENST00000488033 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-209ENST00000488033 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-209ENST00000488033 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.04■■□□□ 1.12
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