RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476025.5

CLEC16A-210, Transcript of C-type lectin domain containing 16A, humanhuman

TSL 4

Gene CLEC16A, Length 530 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC16A-210ENST00000476025 RICTORQ6R327 1708 aa15.15■□□□□ 0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.15■□□□□ 0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.15■□□□□ 0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.14■□□□□ 0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.13■□□□□ 0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.13■□□□□ 0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.12■□□□□ 0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.12■□□□□ 0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 P3H3Q8IVL6 736 aa15.11■□□□□ 0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.11■□□□□ 0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CLEC16A-210ENST00000476025 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.07■□□□□ 0
CLEC16A-210ENST00000476025 ATP10AO60312 1499 aa15.06■□□□□ 0
CLEC16A-210ENST00000476025 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CLEC16A-210ENST00000476025 HECW1Q76N89 1606 aa15.06■□□□□ 0
CLEC16A-210ENST00000476025 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.05■□□□□ -0
CLEC16A-210ENST00000476025 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
CLEC16A-210ENST00000476025 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.03■□□□□ -0
CLEC16A-210ENST00000476025 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CLEC16A-210ENST00000476025 NCOA1Q15788 1441 aa15.02■□□□□ -0
CLEC16A-210ENST00000476025 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.01□□□□□ -0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 HSPA1LP34931 641 aa14.99□□□□□ -0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.99□□□□□ -0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.98□□□□□ -0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 PIP4K2BP78356 416 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC16A-210ENST00000476025 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.94□□□□□ -0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.92□□□□□ -0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 TOM1O60784 492 aa14.92□□□□□ -0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 C3P01024 1663 aa14.92□□□□□ -0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 SAMD9Q5K651 1589 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 PRXQ9BXM0 1461 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 PLCH2O75038 1416 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC16A-210ENST00000476025 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC16A-210ENST00000476025 PKD2Q13563 968 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC16A-210ENST00000476025 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC16A-210ENST00000476025 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC16A-210ENST00000476025 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CLEC16A-210ENST00000476025 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.86□□□□□ -0.03
CLEC16A-210ENST00000476025 AFAP1Q8N556 730 aa14.85□□□□□ -0.03
CLEC16A-210ENST00000476025 NPATQ14207 1427 aa14.83□□□□□ -0.03
CLEC16A-210ENST00000476025 EEA1Q15075 1411 aa14.83□□□□□ -0.03
CLEC16A-210ENST00000476025 AGLP35573 1532 aa14.83□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 REREQ9P2R6 1566 aa14.83□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.83□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 PLA2R1Q13018 1463 aa14.82□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 KDM5CP41229 1560 aa14.81□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 CPS1P31327 1500 aa14.78□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.78□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 PTPRKQ15262 1439 aa14.78□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.78□□□□□ -0.04
CLEC16A-210ENST00000476025 ABCA6Q8N139 1617 aa14.77□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 ZMYM3Q14202 1370 aa14.76□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.76□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.74□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.73□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 MROH2AA6NES4 1674 aa14.72□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.72□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLEC16A-210ENST00000476025 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLEC16A-210ENST00000476025 KIF14Q15058 1648 aa14.69□□□□□ -0.06
CLEC16A-210ENST00000476025 CLIP1P30622 1438 aa14.67□□□□□ -0.06
CLEC16A-210ENST00000476025 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.66□□□□□ -0.06
CLEC16A-210ENST00000476025 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.64□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 ABCC1P33527 1531 aa14.63□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 POTEAQ6S8J7 498 aa14.62□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 ALKQ9UM73 1620 aa14.62□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.61□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 GGT6Q6P531 493 aa14.61□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.6□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.6□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.59□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.59□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 CEP162Q5TB80 1403 aa14.58□□□□□ -0.07
CLEC16A-210ENST00000476025 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLEC16A-210ENST00000476025 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLEC16A-210ENST00000476025 FMN1Q68DA7 1419 aa14.57□□□□□ -0.08
CLEC16A-210ENST00000476025 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CLEC16A-210ENST00000476025 APLP2Q06481 763 aa14.55□□□□□ -0.08
CLEC16A-210ENST00000476025 PREX2Q70Z35 1606 aa14.55□□□□□ -0.08
CLEC16A-210ENST00000476025 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.55□□□□□ -0.08
CLEC16A-210ENST00000476025 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CLEC16A-210ENST00000476025 TNRQ92752 1358 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms