RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474293.2

SOGA3-206, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SOGA3, Length 772 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-206ENST00000474293 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SOGA3-206ENST00000474293 STRCQ7RTU9 1775 aa24.95■■□□□ 1.59
SOGA3-206ENST00000474293 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.95■■□□□ 1.58
SOGA3-206ENST00000474293 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SOGA3-206ENST00000474293 HECW1Q76N89 1606 aa24.94■■□□□ 1.58
SOGA3-206ENST00000474293 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.93■■□□□ 1.58
SOGA3-206ENST00000474293 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.92■■□□□ 1.58
SOGA3-206ENST00000474293 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
SOGA3-206ENST00000474293 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.91■■□□□ 1.58
SOGA3-206ENST00000474293 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.9■■□□□ 1.58
SOGA3-206ENST00000474293 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.88■■□□□ 1.57
SOGA3-206ENST00000474293 SAMD9Q5K651 1589 aa24.88■■□□□ 1.57
SOGA3-206ENST00000474293 ATP10AO60312 1499 aa24.87■■□□□ 1.57
SOGA3-206ENST00000474293 PTPRTO14522 1441 aa24.86■■□□□ 1.57
SOGA3-206ENST00000474293 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.84■■□□□ 1.57
SOGA3-206ENST00000474293 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.83■■□□□ 1.56
SOGA3-206ENST00000474293 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.75■■□□□ 1.55
SOGA3-206ENST00000474293 PLCH2O75038 1416 aa24.75■■□□□ 1.55
SOGA3-206ENST00000474293 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.74■■□□□ 1.55
SOGA3-206ENST00000474293 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.73■■□□□ 1.55
SOGA3-206ENST00000474293 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.7■■□□□ 1.54
SOGA3-206ENST00000474293 AFAP1Q8N556 730 aa24.7■■□□□ 1.54
SOGA3-206ENST00000474293 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SOGA3-206ENST00000474293 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SOGA3-206ENST00000474293 NCOA1Q15788 1441 aa24.67■■□□□ 1.54
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SOGA3-206ENST00000474293 FOXD1Q16676 465 aa24.66■■□□□ 1.54
SOGA3-206ENST00000474293 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.65■■□□□ 1.54
SOGA3-206ENST00000474293 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.65■■□□□ 1.54
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SOGA3-206ENST00000474293 C3P01024 1663 aa24.63■■□□□ 1.53
SOGA3-206ENST00000474293 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.62■■□□□ 1.53
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.61■■□□□ 1.53
SOGA3-206ENST00000474293 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SOGA3-206ENST00000474293 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.57■■□□□ 1.52
SOGA3-206ENST00000474293 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.57■■□□□ 1.52
SOGA3-206ENST00000474293 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SOGA3-206ENST00000474293 HSPA1LP34931 641 aa24.54■■□□□ 1.52
SOGA3-206ENST00000474293 KDM5CP41229 1560 aa24.54■■□□□ 1.52
SOGA3-206ENST00000474293 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.52■■□□□ 1.52
SOGA3-206ENST00000474293 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.51■■□□□ 1.51
SOGA3-206ENST00000474293 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SOGA3-206ENST00000474293 PIP4K2BP78356 416 aa24.51■■□□□ 1.51
SOGA3-206ENST00000474293 ABCA6Q8N139 1617 aa24.5■■□□□ 1.51
SOGA3-206ENST00000474293 REREQ9P2R6 1566 aa24.49■■□□□ 1.51
SOGA3-206ENST00000474293 KIF14Q15058 1648 aa24.46■■□□□ 1.51
SOGA3-206ENST00000474293 AGLP35573 1532 aa24.46■■□□□ 1.51
SOGA3-206ENST00000474293 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.45■■□□□ 1.51
SOGA3-206ENST00000474293 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.45■■□□□ 1.51
SOGA3-206ENST00000474293 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SOGA3-206ENST00000474293 ZMYM3Q14202 1370 aa24.42■■□□□ 1.5
SOGA3-206ENST00000474293 PKD2Q13563 968 aa24.42■■□□□ 1.5
SOGA3-206ENST00000474293 NPATQ14207 1427 aa24.42■■□□□ 1.5
SOGA3-206ENST00000474293 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.39■■□□□ 1.49
SOGA3-206ENST00000474293 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SOGA3-206ENST00000474293 TOM1O60784 492 aa24.36■■□□□ 1.49
SOGA3-206ENST00000474293 PLA2R1Q13018 1463 aa24.34■■□□□ 1.49
SOGA3-206ENST00000474293 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SOGA3-206ENST00000474293 CLIP1P30622 1438 aa24.33■■□□□ 1.49
SOGA3-206ENST00000474293 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.32■■□□□ 1.48
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SOGA3-206ENST00000474293 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.29■■□□□ 1.48
SOGA3-206ENST00000474293 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SOGA3-206ENST00000474293 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.28■■□□□ 1.48
SOGA3-206ENST00000474293 FMN1Q68DA7 1419 aa24.28■■□□□ 1.48
SOGA3-206ENST00000474293 MROH2AA6NES4 1674 aa24.28■■□□□ 1.48
SOGA3-206ENST00000474293 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.28■■□□□ 1.48
SOGA3-206ENST00000474293 PTPRKQ15262 1439 aa24.27■■□□□ 1.48
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SOGA3-206ENST00000474293 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.24■■□□□ 1.47
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SOGA3-206ENST00000474293 EEA1Q15075 1411 aa24.24■■□□□ 1.47
SOGA3-206ENST00000474293 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SOGA3-206ENST00000474293 GGT6Q6P531 493 aa24.23■■□□□ 1.47
SOGA3-206ENST00000474293 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SOGA3-206ENST00000474293 PREX2Q70Z35 1606 aa24.21■■□□□ 1.47
SOGA3-206ENST00000474293 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SOGA3-206ENST00000474293 CPS1P31327 1500 aa24.2■■□□□ 1.46
SOGA3-206ENST00000474293 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.19■■□□□ 1.46
SOGA3-206ENST00000474293 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.19■■□□□ 1.46
SOGA3-206ENST00000474293 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.19■■□□□ 1.46
SOGA3-206ENST00000474293 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SOGA3-206ENST00000474293 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
SOGA3-206ENST00000474293 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.14■■□□□ 1.46
SOGA3-206ENST00000474293 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SOGA3-206ENST00000474293 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.13■■□□□ 1.45
SOGA3-206ENST00000474293 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SOGA3-206ENST00000474293 ALKQ9UM73 1620 aa24.12■■□□□ 1.45
SOGA3-206ENST00000474293 A2MP01023 1474 aa24.11■■□□□ 1.45
SOGA3-206ENST00000474293 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
SOGA3-206ENST00000474293 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.1■■□□□ 1.45
SOGA3-206ENST00000474293 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SOGA3-206ENST00000474293 ATP7AQ04656 1500 aa24.07■■□□□ 1.44
SOGA3-206ENST00000474293 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.06■■□□□ 1.44
SOGA3-206ENST00000474293 PLXNC1O60486 1568 aa24.06■■□□□ 1.44
SOGA3-206ENST00000474293 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.05■■□□□ 1.44
SOGA3-206ENST00000474293 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
SOGA3-206ENST00000474293 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.04■■□□□ 1.44
SOGA3-206ENST00000474293 TNRQ92752 1358 aa24.03■■□□□ 1.44
SOGA3-206ENST00000474293 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
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