RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471582.5

COL20A1-205, Transcript of collagen type XX alpha 1 chain, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene COL20A1, Length 1,924 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1-205ENST00000471582 DAPK1P53355 1430 aa26.79■■□□□ 1.88
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COL20A1-205ENST00000471582 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
COL20A1-205ENST00000471582 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.75■■□□□ 1.87
COL20A1-205ENST00000471582 KIF14Q15058 1648 aa26.74■■□□□ 1.87
COL20A1-205ENST00000471582 ABCC5O15440 1437 aa26.73■■□□□ 1.87
COL20A1-205ENST00000471582 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.73■■□□□ 1.87
COL20A1-205ENST00000471582 TONSLQ96HA7 1378 aa26.73■■□□□ 1.87
COL20A1-205ENST00000471582 KDM6BO15054 1643 aa26.72■■□□□ 1.87
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COL20A1-205ENST00000471582 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.66■■□□□ 1.86
COL20A1-205ENST00000471582 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
COL20A1-205ENST00000471582 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
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COL20A1-205ENST00000471582 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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COL20A1-205ENST00000471582 ADGRL2O95490 1459 aa26.59■■□□□ 1.85
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COL20A1-205ENST00000471582 TRIM52Q96A61 297 aa26.58■■□□□ 1.85
COL20A1-205ENST00000471582 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.56■■□□□ 1.84
COL20A1-205ENST00000471582 NCOA1Q15788 1441 aa26.53■■□□□ 1.84
COL20A1-205ENST00000471582 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.51■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.5■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.5■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.5■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.47■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 PREX2Q70Z35 1606 aa26.47■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.46■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.45■■□□□ 1.83
COL20A1-205ENST00000471582 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.44■■□□□ 1.82
COL20A1-205ENST00000471582 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
COL20A1-205ENST00000471582 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.43■■□□□ 1.82
COL20A1-205ENST00000471582 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.42■■□□□ 1.82
COL20A1-205ENST00000471582 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.42■■□□□ 1.82
COL20A1-205ENST00000471582 PZPP20742 1482 aa26.41■■□□□ 1.82
COL20A1-205ENST00000471582 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.4■■□□□ 1.82
COL20A1-205ENST00000471582 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.38■■□□□ 1.81
COL20A1-205ENST00000471582 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
COL20A1-205ENST00000471582 KCNH8Q96L42 1107 aa26.37■■□□□ 1.81
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COL20A1-205ENST00000471582 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
COL20A1-205ENST00000471582 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.35■■□□□ 1.81
COL20A1-205ENST00000471582 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.35■■□□□ 1.81
COL20A1-205ENST00000471582 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.34■■□□□ 1.81
COL20A1-205ENST00000471582 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.34■■□□□ 1.81
COL20A1-205ENST00000471582 ASXL2Q76L83 1435 aa26.34■■□□□ 1.81
COL20A1-205ENST00000471582 MBD5Q9P267 1494 aa26.32■■□□□ 1.8
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COL20A1-205ENST00000471582 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.31■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 TSPY4P0CV99 314 aa26.3■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 TSPY10P0CW01 314 aa26.3■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.3■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 PLCH2O75038 1416 aa26.3■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.3■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.29■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.29■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.28■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.28■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.28■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.27■■□□□ 1.8
COL20A1-205ENST00000471582 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
COL20A1-205ENST00000471582 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.23■■□□□ 1.79
COL20A1-205ENST00000471582 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.22■■□□□ 1.79
COL20A1-205ENST00000471582 KIF15Q9NS87 1388 aa26.21■■□□□ 1.79
COL20A1-205ENST00000471582 CCER2I3L3R5 266 aa26.2■■□□□ 1.79
COL20A1-205ENST00000471582 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
COL20A1-205ENST00000471582 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.2■■□□□ 1.78
COL20A1-205ENST00000471582 ANP32CO43423 234 aa26.18■■□□□ 1.78
COL20A1-205ENST00000471582 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
COL20A1-205ENST00000471582 PKD2Q13563 968 aa26.16■■□□□ 1.78
COL20A1-205ENST00000471582 NUP155O75694 1391 aa26.15■■□□□ 1.78
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COL20A1-205ENST00000471582 PLXNC1O60486 1568 aa26.12■■□□□ 1.77
COL20A1-205ENST00000471582 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.11■■□□□ 1.77
COL20A1-205ENST00000471582 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.1■■□□□ 1.77
COL20A1-205ENST00000471582 FANCAO15360 1455 aa26.1■■□□□ 1.77
COL20A1-205ENST00000471582 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.09■■□□□ 1.77
COL20A1-205ENST00000471582 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.08■■□□□ 1.77
COL20A1-205ENST00000471582 UNC13BO14795 1591 aa26.06■■□□□ 1.76
COL20A1-205ENST00000471582 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.06■■□□□ 1.76
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COL20A1-205ENST00000471582 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.04■■□□□ 1.76
COL20A1-205ENST00000471582 CD109Q6YHK3 1445 aa26.03■■□□□ 1.76
COL20A1-205ENST00000471582 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.02■■□□□ 1.76
COL20A1-205ENST00000471582 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.02■■□□□ 1.76
COL20A1-205ENST00000471582 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.02■■□□□ 1.76
COL20A1-205ENST00000471582 CCDC7Q96M83 1385 aa26■■□□□ 1.75
COL20A1-205ENST00000471582 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.99■■□□□ 1.75
COL20A1-205ENST00000471582 ADGRL1O94910 1474 aa25.99■■□□□ 1.75
COL20A1-205ENST00000471582 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.98■■□□□ 1.75
COL20A1-205ENST00000471582 GLI2P10070 1586 aa25.98■■□□□ 1.75
COL20A1-205ENST00000471582 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.95■■□□□ 1.75
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