RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 NCOA1Q15788 1441 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM6BO15054 1643 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 ARID3CA6NKF2 412 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 IFT140Q96RY7 1462 aa18.36■□□□□ 0.53
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SH3BP1-206ENST00000469947 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 PBRM1Q86U86 1689 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.33■□□□□ 0.52
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SH3BP1-206ENST00000469947 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
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SH3BP1-206ENST00000469947 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 GRIN2BQ13224 1484 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 HECW1Q76N89 1606 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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SH3BP1-206ENST00000469947 IL27Q8NEV9 243 aa18.25■□□□□ 0.51
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SH3BP1-206ENST00000469947 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.22■□□□□ 0.51
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SH3BP1-206ENST00000469947 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 SAMD9Q5K651 1589 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF11O15085 1522 aa18.21■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
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SH3BP1-206ENST00000469947 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1-206ENST00000469947 FBLN2P98095 1184 aa18.15■□□□□ 0.5
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SH3BP1-206ENST00000469947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 GRIN2AQ12879 1464 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 IQGAP2Q13576 1575 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PDE4AP27815 886 aa18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 DAPK1P53355 1430 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 MIA2Q96PC5 1412 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 SYNJ2O15056 1496 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCC5O15440 1437 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 USP35Q9P2H5 1018 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 PLIN1O60240 522 aa18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 BACH2Q9BYV9 841 aa18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 CEP170Q5SW79 1584 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 PZPP20742 1482 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 ROCK1Q13464 1354 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 PKD2Q13563 968 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 CDCA7LQ96GN5 454 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 CARD11Q9BXL7 1154 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 MBD5Q9P267 1494 aa17.98■□□□□ 0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC4A3P48751 1232 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF15Q9NS87 1388 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 DISP1Q96F81 1524 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 BRPF3Q9ULD4 1205 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM5CP41229 1560 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP160Q12769 1436 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 MS4A1P11836 297 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
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