RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464025.5

LMO2-204, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMO2, Length 1,550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-204ENST00000464025 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.2■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.19■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.19■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 KDM6BO15054 1643 aa25.19■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.18■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.17■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.17■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.16■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 ADGRL2O95490 1459 aa25.14■■□□□ 1.62
LMO2-204ENST00000464025 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
LMO2-204ENST00000464025 TONSLQ96HA7 1378 aa25.13■■□□□ 1.61
LMO2-204ENST00000464025 NCOA1Q15788 1441 aa25.08■■□□□ 1.6
LMO2-204ENST00000464025 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO2-204ENST00000464025 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO2-204ENST00000464025 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO2-204ENST00000464025 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO2-204ENST00000464025 TRIM52Q96A61 297 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO2-204ENST00000464025 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.01■■□□□ 1.59
LMO2-204ENST00000464025 ABCC2Q92887 1545 aa25.01■■□□□ 1.59
LMO2-204ENST00000464025 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.99■■□□□ 1.59
LMO2-204ENST00000464025 PREX2Q70Z35 1606 aa24.99■■□□□ 1.59
LMO2-204ENST00000464025 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
LMO2-204ENST00000464025 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.97■■□□□ 1.59
LMO2-204ENST00000464025 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.96■■□□□ 1.59
LMO2-204ENST00000464025 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.95■■□□□ 1.59
LMO2-204ENST00000464025 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.95■■□□□ 1.58
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LMO2-204ENST00000464025 PZPP20742 1482 aa24.93■■□□□ 1.58
LMO2-204ENST00000464025 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
LMO2-204ENST00000464025 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.91■■□□□ 1.58
LMO2-204ENST00000464025 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.91■■□□□ 1.58
LMO2-204ENST00000464025 MBD5Q9P267 1494 aa24.9■■□□□ 1.58
LMO2-204ENST00000464025 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.89■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.88■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.86■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.84■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.84■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.84■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 TSPY4P0CV99 314 aa24.84■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 TSPY10P0CW01 314 aa24.84■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.83■■□□□ 1.57
LMO2-204ENST00000464025 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.82■■□□□ 1.56
LMO2-204ENST00000464025 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.82■■□□□ 1.56
LMO2-204ENST00000464025 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
LMO2-204ENST00000464025 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.81■■□□□ 1.56
LMO2-204ENST00000464025 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.78■■□□□ 1.56
LMO2-204ENST00000464025 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
LMO2-204ENST00000464025 FOXD1Q16676 465 aa24.76■■□□□ 1.55
LMO2-204ENST00000464025 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.76■■□□□ 1.55
LMO2-204ENST00000464025 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
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LMO2-204ENST00000464025 KIF15Q9NS87 1388 aa24.74■■□□□ 1.55
LMO2-204ENST00000464025 PLCH2O75038 1416 aa24.72■■□□□ 1.55
LMO2-204ENST00000464025 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.72■■□□□ 1.55
LMO2-204ENST00000464025 PLXNC1O60486 1568 aa24.71■■□□□ 1.55
LMO2-204ENST00000464025 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.7■■□□□ 1.54
LMO2-204ENST00000464025 NUP155O75694 1391 aa24.68■■□□□ 1.54
LMO2-204ENST00000464025 PKD2Q13563 968 aa24.67■■□□□ 1.54
LMO2-204ENST00000464025 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.67■■□□□ 1.54
LMO2-204ENST00000464025 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
LMO2-204ENST00000464025 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
LMO2-204ENST00000464025 UNC13BO14795 1591 aa24.65■■□□□ 1.54
LMO2-204ENST00000464025 CCER2I3L3R5 266 aa24.63■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.61■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.61■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 ABCC1P33527 1531 aa24.6■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.59■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.58■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.58■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.58■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
LMO2-204ENST00000464025 ANP32CO43423 234 aa24.57■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 KCNH8Q96L42 1107 aa24.57■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.57■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.55■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 ERBINQ96RT1 1412 aa24.55■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.54■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.54■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.53■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.52■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.52■■□□□ 1.52
LMO2-204ENST00000464025 CCDC7Q96M83 1385 aa24.47■■□□□ 1.51
LMO2-204ENST00000464025 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.46■■□□□ 1.51
LMO2-204ENST00000464025 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.45■■□□□ 1.51
LMO2-204ENST00000464025 ATP10AO60312 1499 aa24.45■■□□□ 1.5
LMO2-204ENST00000464025 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.45■■□□□ 1.5
LMO2-204ENST00000464025 OSCARQ8IYS5 282 aa24.43■■□□□ 1.5
LMO2-204ENST00000464025 KDM5CP41229 1560 aa24.41■■□□□ 1.5
LMO2-204ENST00000464025 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.4■■□□□ 1.5
LMO2-204ENST00000464025 PLA2R1Q13018 1463 aa24.39■■□□□ 1.49
LMO2-204ENST00000464025 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
LMO2-204ENST00000464025 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
LMO2-204ENST00000464025 FANCAO15360 1455 aa24.38■■□□□ 1.49
LMO2-204ENST00000464025 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.37■■□□□ 1.49
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