RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438196.2

RPS29P6-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P6, Length 145 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P6-201ENST00000438196 ABCC10Q5T3U5 1492 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 NBPF8Q3BBV2 869 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 BCORL1Q5H9F3 1711 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 ABCA8O94911 1581 aa4.14□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 DAPK1P53355 1430 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 NCOA1Q15788 1441 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 ADGBQ8N7X0 1667 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 MPHOSPH9Q99550 1183 aa4.13□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 CCDC184Q52MB2 194 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 L3MBTL2Q969R5 705 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 KIF14Q15058 1648 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 PTPRGP23470 1445 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 KDM5DQ9BY66 1539 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 SYNJ2O15056 1496 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 ATP10BO94823 1461 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 RNF123Q5XPI4 1314 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 CCDC7Q96M83 1385 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 PLB1Q6P1J6 1458 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 KDM5CP41229 1560 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 ARHGEF5Q12774 1597 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 SHROOM2Q13796 1616 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 ITSN2Q9NZM3 1697 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 TONSLQ96HA7 1378 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS29P6-201ENST00000438196 E9PCH4 1651 aa4.09□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 ARID3CA6NKF2 412 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 PLA2R1Q13018 1463 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 CNTLNQ9NXG0 1405 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 CHIC2Q9UKJ5 165 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 SHANK2Q9UPX8 1470 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 MAST1Q9Y2H9 1570 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 KIF7Q2M1P5 1343 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 FBLN2P98095 1184 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 FOXD1Q16676 465 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 JPH4Q96JJ6 628 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 ATP10AO60312 1499 aa4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 ERICH6BQ5W0A0 696 aa4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 LAMC1P11047 1609 aa4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 PREX2Q70Z35 1606 aa4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 UNC13BO14795 1591 aa4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa4.06□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 RALGAPBQ86X10 1494 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 ANP32CO43423 234 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 FKBP8Q14318 412 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 MAGI2Q86UL8 1455 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 GPRASP1Q5JY77 1395 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 MSH5O43196 834 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 TRIM52Q96A61 297 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 CHD1O14646 1710 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 IQGAP3Q86VI3 1631 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 ZBED9Q6R2W3 1325 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 PLXNC1O60486 1568 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 C9orf84Q5VXU9 1444 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS29P6-201ENST00000438196 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 ERCC6L2Q5T890 1561 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 MYO5CQ9NQX4 1742 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 MYT1Q01538 1121 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 PKD2Q13563 968 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 TTC37Q6PGP7 1564 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 VWDEQ8N2E2 1590 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 INSRP06213 1382 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 CLASP1Q7Z460 1538 aa4.01□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 FAM135AQ9P2D6 1515 aa4.01□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa4.01□□□□□ -1.77
RPS29P6-201ENST00000438196 RSPH4AQ5TD94 716 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms