RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 STRCQ7RTU9 1775 aa33.09■■■□□ 2.89
GTPBP1-202ENST00000418601 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.07■■■□□ 2.89
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.07■■■□□ 2.88
GTPBP1-202ENST00000418601 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.99■■■□□ 2.87
GTPBP1-202ENST00000418601 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.96■■■□□ 2.87
GTPBP1-202ENST00000418601 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.94■■■□□ 2.86
GTPBP1-202ENST00000418601 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.94■■■□□ 2.86
GTPBP1-202ENST00000418601 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
GTPBP1-202ENST00000418601 ATP10AO60312 1499 aa32.91■■■□□ 2.86
GTPBP1-202ENST00000418601 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.9■■■□□ 2.86
GTPBP1-202ENST00000418601 PTPRTO14522 1441 aa32.85■■■□□ 2.85
GTPBP1-202ENST00000418601 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.83■■■□□ 2.85
GTPBP1-202ENST00000418601 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.8■■■□□ 2.84
GTPBP1-202ENST00000418601 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
GTPBP1-202ENST00000418601 PLCH2O75038 1416 aa32.78■■■□□ 2.84
GTPBP1-202ENST00000418601 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
GTPBP1-202ENST00000418601 C3P01024 1663 aa32.76■■■□□ 2.84
GTPBP1-202ENST00000418601 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.75■■■□□ 2.83
GTPBP1-202ENST00000418601 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.7■■■□□ 2.83
GTPBP1-202ENST00000418601 KDM5CP41229 1560 aa32.68■■■□□ 2.82
GTPBP1-202ENST00000418601 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.68■■■□□ 2.82
GTPBP1-202ENST00000418601 NCOA1Q15788 1441 aa32.64■■■□□ 2.82
GTPBP1-202ENST00000418601 REREQ9P2R6 1566 aa32.64■■■□□ 2.82
GTPBP1-202ENST00000418601 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.62■■■□□ 2.81
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCA6Q8N139 1617 aa32.62■■■□□ 2.81
GTPBP1-202ENST00000418601 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.6■■■□□ 2.81
GTPBP1-202ENST00000418601 KIF14Q15058 1648 aa32.57■■■□□ 2.8
GTPBP1-202ENST00000418601 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.57■■■□□ 2.8
GTPBP1-202ENST00000418601 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.56■■■□□ 2.8
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.56■■■□□ 2.8
GTPBP1-202ENST00000418601 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.54■■■□□ 2.8
GTPBP1-202ENST00000418601 AFAP1Q8N556 730 aa32.52■■■□□ 2.8
GTPBP1-202ENST00000418601 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
GTPBP1-202ENST00000418601 AGLP35573 1532 aa32.51■■■□□ 2.8
GTPBP1-202ENST00000418601 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.48■■■□□ 2.79
GTPBP1-202ENST00000418601 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.45■■■□□ 2.79
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.78
GTPBP1-202ENST00000418601 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.44■■■□□ 2.78
GTPBP1-202ENST00000418601 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
GTPBP1-202ENST00000418601 MROH2AA6NES4 1674 aa32.4■■■□□ 2.78
GTPBP1-202ENST00000418601 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.37■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.37■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCC1P33527 1531 aa32.37■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 NPATQ14207 1427 aa32.37■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 EEA1Q15075 1411 aa32.36■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.35■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32.34■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 CLIP1P30622 1438 aa32.34■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.33■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 PREX2Q70Z35 1606 aa32.33■■■□□ 2.77
GTPBP1-202ENST00000418601 FMN1Q68DA7 1419 aa32.32■■■□□ 2.76
GTPBP1-202ENST00000418601 PLA2R1Q13018 1463 aa32.3■■■□□ 2.76
GTPBP1-202ENST00000418601 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
GTPBP1-202ENST00000418601 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
GTPBP1-202ENST00000418601 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.25■■■□□ 2.75
GTPBP1-202ENST00000418601 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
GTPBP1-202ENST00000418601 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
GTPBP1-202ENST00000418601 ZMYM3Q14202 1370 aa32.21■■■□□ 2.75
GTPBP1-202ENST00000418601 HSPA1LP34931 641 aa32.21■■■□□ 2.75
GTPBP1-202ENST00000418601 PKD2Q13563 968 aa32.21■■■□□ 2.75
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.16■■■□□ 2.74
GTPBP1-202ENST00000418601 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.15■■■□□ 2.74
GTPBP1-202ENST00000418601 PIP4K2BP78356 416 aa32.15■■■□□ 2.74
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.15■■■□□ 2.74
GTPBP1-202ENST00000418601 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.12■■■□□ 2.73
GTPBP1-202ENST00000418601 PTPRKQ15262 1439 aa32.1■■■□□ 2.73
GTPBP1-202ENST00000418601 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
GTPBP1-202ENST00000418601 CPS1P31327 1500 aa32.08■■■□□ 2.73
GTPBP1-202ENST00000418601 PLXNC1O60486 1568 aa32.07■■■□□ 2.72
GTPBP1-202ENST00000418601 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
GTPBP1-202ENST00000418601 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.06■■■□□ 2.72
GTPBP1-202ENST00000418601 TOM1O60784 492 aa32.04■■■□□ 2.72
GTPBP1-202ENST00000418601 ATP7AQ04656 1500 aa32.03■■■□□ 2.72
GTPBP1-202ENST00000418601 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
GTPBP1-202ENST00000418601 NEURL4Q96JN8 1562 aa32■■■□□ 2.71
GTPBP1-202ENST00000418601 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
GTPBP1-202ENST00000418601 A2ML1A8K2U0 1454 aa32■■■□□ 2.71
GTPBP1-202ENST00000418601 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
GTPBP1-202ENST00000418601 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.98■■■□□ 2.71
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.97■■■□□ 2.71
GTPBP1-202ENST00000418601 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.97■■■□□ 2.71
GTPBP1-202ENST00000418601 A2MP01023 1474 aa31.97■■■□□ 2.71
GTPBP1-202ENST00000418601 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
GTPBP1-202ENST00000418601 ALKQ9UM73 1620 aa31.93■■■□□ 2.7
GTPBP1-202ENST00000418601 GGT6Q6P531 493 aa31.91■■■□□ 2.7
GTPBP1-202ENST00000418601 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.88■■■□□ 2.69
GTPBP1-202ENST00000418601 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.87■■■□□ 2.69
GTPBP1-202ENST00000418601 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
GTPBP1-202ENST00000418601 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.83■■■□□ 2.69
GTPBP1-202ENST00000418601 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
GTPBP1-202ENST00000418601 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
GTPBP1-202ENST00000418601 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.8■■■□□ 2.68
GTPBP1-202ENST00000418601 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.78■■■□□ 2.68
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