RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.12■■■□□ 2.25
SUMO3-204ENST00000411651 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
SUMO3-204ENST00000411651 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.11■■■□□ 2.25
SUMO3-204ENST00000411651 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.11■■■□□ 2.25
SUMO3-204ENST00000411651 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.09■■■□□ 2.25
SUMO3-204ENST00000411651 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.09■■■□□ 2.25
SUMO3-204ENST00000411651 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.09■■■□□ 2.25
SUMO3-204ENST00000411651 KDM6BO15054 1643 aa29.09■■■□□ 2.25
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
SUMO3-204ENST00000411651 NEUROD1Q13562 356 aa29.06■■■□□ 2.24
SUMO3-204ENST00000411651 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.06■■■□□ 2.24
SUMO3-204ENST00000411651 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SUMO3-204ENST00000411651 TONSLQ96HA7 1378 aa29.04■■■□□ 2.24
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SUMO3-204ENST00000411651 ABCC2Q92887 1545 aa29.02■■■□□ 2.24
SUMO3-204ENST00000411651 NCOA1Q15788 1441 aa29.01■■■□□ 2.23
SUMO3-204ENST00000411651 MIER1Q8N108 512 aa28.98■■■□□ 2.23
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.97■■■□□ 2.23
SUMO3-204ENST00000411651 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
SUMO3-204ENST00000411651 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.95■■■□□ 2.22
SUMO3-204ENST00000411651 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.94■■■□□ 2.22
SUMO3-204ENST00000411651 PREX2Q70Z35 1606 aa28.94■■■□□ 2.22
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.93■■■□□ 2.22
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM52Q96A61 297 aa28.93■■■□□ 2.22
SUMO3-204ENST00000411651 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.93■■■□□ 2.22
SUMO3-204ENST00000411651 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.91■■■□□ 2.22
SUMO3-204ENST00000411651 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.85■■■□□ 2.21
SUMO3-204ENST00000411651 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.85■■■□□ 2.21
SUMO3-204ENST00000411651 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.85■■■□□ 2.21
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.85■■■□□ 2.21
SUMO3-204ENST00000411651 MBD5Q9P267 1494 aa28.84■■■□□ 2.21
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SUMO3-204ENST00000411651 PZPP20742 1482 aa28.82■■■□□ 2.2
SUMO3-204ENST00000411651 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SUMO3-204ENST00000411651 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.81■■■□□ 2.2
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.8■■■□□ 2.2
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.8■■■□□ 2.2
SUMO3-204ENST00000411651 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.22e-6■■■□□ 14.8
SUMO3-204ENST00000411651 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.78■■■□□ 2.2
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.78■■■□□ 2.2
SUMO3-204ENST00000411651 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.77■■■□□ 2.2
SUMO3-204ENST00000411651 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.77■■■□□ 2.2
SUMO3-204ENST00000411651 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SUMO3-204ENST00000411651 TSPY4P0CV99 314 aa28.75■■■□□ 2.19
SUMO3-204ENST00000411651 TSPY10P0CW01 314 aa28.75■■■□□ 2.19
SUMO3-204ENST00000411651 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.75■■■□□ 2.19
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.74■■■□□ 2.19
SUMO3-204ENST00000411651 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.69■■■□□ 2.18
SUMO3-204ENST00000411651 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.69■■■□□ 2.18
SUMO3-204ENST00000411651 KIF15Q9NS87 1388 aa28.66■■■□□ 2.18
SUMO3-204ENST00000411651 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.66■■■□□ 2.18
SUMO3-204ENST00000411651 PLCH2O75038 1416 aa28.64■■■□□ 2.18
SUMO3-204ENST00000411651 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.64■■■□□ 2.18
SUMO3-204ENST00000411651 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
SUMO3-204ENST00000411651 PLXNC1O60486 1568 aa28.63■■■□□ 2.17
SUMO3-204ENST00000411651 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
SUMO3-204ENST00000411651 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.6■■■□□ 2.17
SUMO3-204ENST00000411651 FOXD1Q16676 465 aa28.58■■■□□ 2.17
SUMO3-204ENST00000411651 NUP155O75694 1391 aa28.55■■■□□ 2.16
SUMO3-204ENST00000411651 UNC13BO14795 1591 aa28.53■■■□□ 2.16
SUMO3-204ENST00000411651 ABCC1P33527 1531 aa28.53■■■□□ 2.16
SUMO3-204ENST00000411651 PKD2Q13563 968 aa28.51■■■□□ 2.16
SUMO3-204ENST00000411651 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SUMO3-204ENST00000411651 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.5■■■□□ 2.15
SUMO3-204ENST00000411651 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.49■■■□□ 2.15
SUMO3-204ENST00000411651 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
SUMO3-204ENST00000411651 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.48■■■□□ 2.15
SUMO3-204ENST00000411651 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.153e-7■■■■■ 67
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.47■■■□□ 2.15
SUMO3-204ENST00000411651 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.46■■■□□ 2.15
SUMO3-204ENST00000411651 ERBINQ96RT1 1412 aa28.45■■■□□ 2.15
SUMO3-204ENST00000411651 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.43■■■□□ 2.14
SUMO3-204ENST00000411651 KCNH8Q96L42 1107 aa28.43■■■□□ 2.14
SUMO3-204ENST00000411651 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.43■■■□□ 2.14
SUMO3-204ENST00000411651 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SUMO3-204ENST00000411651 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.41■■■□□ 2.14
SUMO3-204ENST00000411651 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.41■■■□□ 2.14
SUMO3-204ENST00000411651 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.41■■■□□ 2.14
SUMO3-204ENST00000411651 CCER2I3L3R5 266 aa28.4■■■□□ 2.14
SUMO3-204ENST00000411651 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SUMO3-204ENST00000411651 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.38■■■□□ 2.13
SUMO3-204ENST00000411651 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.37■■■□□ 2.13
SUMO3-204ENST00000411651 OSCARQ8IYS5 282 aa28.36■■■□□ 2.13
SUMO3-204ENST00000411651 ANP32CO43423 234 aa28.34■■■□□ 2.13
SUMO3-204ENST00000411651 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SUMO3-204ENST00000411651 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.33■■■□□ 2.13
SUMO3-204ENST00000411651 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.31■■■□□ 2.12
SUMO3-204ENST00000411651 ATP10AO60312 1499 aa28.31■■■□□ 2.12
SUMO3-204ENST00000411651 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.3■■■□□ 2.12
SUMO3-204ENST00000411651 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.3■■■□□ 2.12
SUMO3-204ENST00000411651 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.29■■■□□ 2.12
SUMO3-204ENST00000411651 ASXL2Q76L83 1435 aa28.28■■■□□ 2.12
SUMO3-204ENST00000411651 FANCAO15360 1455 aa28.27■■■□□ 2.12
SUMO3-204ENST00000411651 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC7Q96M83 1385 aa28.24■■■□□ 2.11
SUMO3-204ENST00000411651 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.23■■■□□ 2.11
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.23■■■□□ 2.11
SUMO3-204ENST00000411651 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
SUMO3-204ENST00000411651 KDM5CP41229 1560 aa28.2■■■□□ 2.1
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