RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411044.1

RN7SKP94-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 94, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP94, Length 284 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP94-201ENST00000411044 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.24■□□□□ 0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.23■□□□□ 0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.23■□□□□ 0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 HECW1Q76N89 1606 aa15.22■□□□□ 0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.22■□□□□ 0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.21■□□□□ 0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.21■□□□□ 0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.19■□□□□ 0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.18■□□□□ 0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.18■□□□□ 0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 ATP10AO60312 1499 aa15.18■□□□□ 0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 STRCQ7RTU9 1775 aa15.18■□□□□ 0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.17■□□□□ 0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.17■□□□□ 0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.16■□□□□ 0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 PLCH2O75038 1416 aa15.14■□□□□ 0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 PTPRTO14522 1441 aa15.12■□□□□ 0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.12■□□□□ 0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 AFAP1Q8N556 730 aa15.11■□□□□ 0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.08■□□□□ 0
RN7SKP94-201ENST00000411044 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.05■□□□□ -0
RN7SKP94-201ENST00000411044 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.04■□□□□ -0
RN7SKP94-201ENST00000411044 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.03■□□□□ -0
RN7SKP94-201ENST00000411044 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.03■□□□□ -0
RN7SKP94-201ENST00000411044 C3P01024 1663 aa15.02□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 NCOA1Q15788 1441 aa15.01□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.01□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.01□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 KDM5CP41229 1560 aa14.99□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 KIF14Q15058 1648 aa14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP94-201ENST00000411044 ABCA6Q8N139 1617 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 REREQ9P2R6 1566 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 EEA1Q15075 1411 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 AGLP35573 1532 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 FOXD1Q16676 465 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 ZMYM3Q14202 1370 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 CLIP1P30622 1438 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 FMN1Q68DA7 1419 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 HSPA1LP34931 641 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 PIP4K2BP78356 416 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 PKD2Q13563 968 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 NPATQ14207 1427 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP94-201ENST00000411044 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.87□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 ABCC1P33527 1531 aa14.86□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.85□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.85□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 TOM1O60784 492 aa14.85□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 GGT6Q6P531 493 aa14.84□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 PLA2R1Q13018 1463 aa14.83□□□□□ -0.03
RN7SKP94-201ENST00000411044 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.83□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 MROH2AA6NES4 1674 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 PREX2Q70Z35 1606 aa14.81□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.81□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 PTPRKQ15262 1439 aa14.8□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.8□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.79□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
RN7SKP94-201ENST00000411044 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 A2MP01023 1474 aa14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.74□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 CPS1P31327 1500 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 ATP7AQ04656 1500 aa14.72□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.72□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RN7SKP94-201ENST00000411044 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
RN7SKP94-201ENST00000411044 PLXNC1O60486 1568 aa14.7□□□□□ -0.06
RN7SKP94-201ENST00000411044 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.7□□□□□ -0.06
RN7SKP94-201ENST00000411044 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.7□□□□□ -0.06
RN7SKP94-201ENST00000411044 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP94-201ENST00000411044 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP94-201ENST00000411044 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms