RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 PLCH2O75038 1416 aa22.76■■□□□ 1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 EEA1Q15075 1411 aa22.74■■□□□ 1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 ATP10AO60312 1499 aa22.72■■□□□ 1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.71■■□□□ 1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.7■■□□□ 1.22
CHCHD2-201ENST00000395422 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.65■■□□□ 1.22
CHCHD2-201ENST00000395422 ILDR2Q71H61 639 aa22.63■■□□□ 1.21
CHCHD2-201ENST00000395422 AFAP1Q8N556 730 aa22.62■■□□□ 1.21
CHCHD2-201ENST00000395422 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CHCHD2-201ENST00000395422 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.61■■□□□ 1.21
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.59■■□□□ 1.21
CHCHD2-201ENST00000395422 KIF14Q15058 1648 aa22.58■■□□□ 1.21
CHCHD2-201ENST00000395422 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.58■■□□□ 1.21
CHCHD2-201ENST00000395422 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.57■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 STRCQ7RTU9 1775 aa22.57■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 KDM5CP41229 1560 aa22.56■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.56■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.56■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 FMN1Q68DA7 1419 aa22.56■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.54■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.54■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.53■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.53■■□□□ 1.2
CHCHD2-201ENST00000395422 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.5■■□□□ 1.19
CHCHD2-201ENST00000395422 SOCS7O14512 581 aa22.49■■□□□ 1.19
CHCHD2-201ENST00000395422 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CHCHD2-201ENST00000395422 PTPRTO14522 1441 aa22.48■■□□□ 1.19
CHCHD2-201ENST00000395422 REREQ9P2R6 1566 aa22.48■■□□□ 1.19
CHCHD2-201ENST00000395422 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.48■■□□□ 1.19
CHCHD2-201ENST00000395422 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.47■■□□□ 1.19
CHCHD2-201ENST00000395422 ABCA6Q8N139 1617 aa22.46■■□□□ 1.19
CHCHD2-201ENST00000395422 CLIP1P30622 1438 aa22.45■■□□□ 1.18
CHCHD2-201ENST00000395422 C3P01024 1663 aa22.43■■□□□ 1.18
CHCHD2-201ENST00000395422 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.43■■□□□ 1.18
CHCHD2-201ENST00000395422 AGLP35573 1532 aa22.43■■□□□ 1.18
CHCHD2-201ENST00000395422 ABCC1P33527 1531 aa22.41■■□□□ 1.18
CHCHD2-201ENST00000395422 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CHCHD2-201ENST00000395422 NCOA1Q15788 1441 aa22.4■■□□□ 1.18
CHCHD2-201ENST00000395422 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CHCHD2-201ENST00000395422 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.39■■□□□ 1.17
CHCHD2-201ENST00000395422 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.39■■□□□ 1.17
CHCHD2-201ENST00000395422 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.38■■□□□ 1.17
CHCHD2-201ENST00000395422 PREX2Q70Z35 1606 aa22.35■■□□□ 1.17
CHCHD2-201ENST00000395422 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.34■■□□□ 1.17
CHCHD2-201ENST00000395422 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.33■■□□□ 1.17
CHCHD2-201ENST00000395422 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.33■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.32■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 ZMYM3Q14202 1370 aa22.29■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.29■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 NPATQ14207 1427 aa22.29■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.29■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.29■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.28■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.27■■□□□ 1.16
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CHCHD2-201ENST00000395422 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2-201ENST00000395422 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2-201ENST00000395422 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2-201ENST00000395422 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.22■■□□□ 1.15
CHCHD2-201ENST00000395422 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CHCHD2-201ENST00000395422 MROH2AA6NES4 1674 aa22.2■■□□□ 1.15
CHCHD2-201ENST00000395422 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.2■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 PTPRKQ15262 1439 aa22.18■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.18■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 PLA2R1Q13018 1463 aa22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 PLXNC1O60486 1568 aa22.16■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 PKD2Q13563 968 aa22.16■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 ATP7AQ04656 1500 aa22.16■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 A2MP01023 1474 aa22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2-201ENST00000395422 GGT6Q6P531 493 aa22.14■■□□□ 1.13
CHCHD2-201ENST00000395422 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.14■■□□□ 1.13
CHCHD2-201ENST00000395422 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CHCHD2-201ENST00000395422 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CHCHD2-201ENST00000395422 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CHCHD2-201ENST00000395422 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CHCHD2-201ENST00000395422 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.1■■□□□ 1.13
CHCHD2-201ENST00000395422 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.08■■□□□ 1.12
CHCHD2-201ENST00000395422 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.06■■□□□ 1.12
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CHCHD2-201ENST00000395422 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.03■■□□□ 1.12
CHCHD2-201ENST00000395422 HSPA1LP34931 641 aa22.03■■□□□ 1.12
CHCHD2-201ENST00000395422 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CHCHD2-201ENST00000395422 MBD5Q9P267 1494 aa22.01■■□□□ 1.11
CHCHD2-201ENST00000395422 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CHCHD2-201ENST00000395422 PIP4K2BP78356 416 aa21.99■■□□□ 1.11
CHCHD2-201ENST00000395422 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CHCHD2-201ENST00000395422 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.98■■□□□ 1.11
CHCHD2-201ENST00000395422 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.98■■□□□ 1.11
CHCHD2-201ENST00000395422 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CHCHD2-201ENST00000395422 TNRQ92752 1358 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms