RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIF21BO75037 1637 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERCC6Q03468 1493 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 MAP7D2Q96T17 732 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 TEX35Q5T0J7 233 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 TAF3Q5VWG9 929 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDE4CQ08493 712 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 TONSLQ96HA7 1378 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSCBQ8IWL3 235 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 GBP4Q96PP9 640 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 GRIN2BQ13224 1484 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 IFT140Q96RY7 1462 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC66A2RUB6 948 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 GPS2Q13227 327 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 PHF14O94880 888 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
PTPRZ1-201ENST00000393386 AK9Q5TCS8 1911 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRS2Q9HD23 443 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 GSE1Q14687 1217 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 TPRNQ4KMQ1 711 aa7□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTPRKQ15262 1439 aa7□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 CFAP44Q96MT7 982 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 NUP160Q12769 1436 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 TPM2P07951 284 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 GRIN2AQ12879 1464 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEFHP12036 1026 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 DISP1Q96F81 1524 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 TPM4P67936 248 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTPRGP23470 1445 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 WDR62O43379 1518 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 KCNH8Q96L42 1107 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 MCCP23508 829 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 DEF6Q9H4E7 631 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 FMN1Q68DA7 1419 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 RGS3P49796 1198 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 SYNJ2O15056 1496 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRZ1-201ENST00000393386 TCHHQ07283 1943 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms