RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRN2-201ENST00000389413 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRN2-201ENST00000389413 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRN2-201ENST00000389413 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRN2-201ENST00000389413 KANK1Q14678 1352 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRN2-201ENST00000389413 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PTPRN2-201ENST00000389413 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRN2-201ENST00000389413 UACAQ9BZF9 1416 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRN2-201ENST00000389413 TOP2BQ02880 1626 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRN2-201ENST00000389413 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRN2-201ENST00000389413 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRN2-201ENST00000389413 NLRP13Q86W25 1043 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 CFTRP13569 1480 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 27.1
PTPRN2-201ENST00000389413 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 CUX1P39880 1505 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 PDE3BQ13370 1112 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 JPH4Q96JJ6 628 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 MS4A1P11836 297 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 KIF15Q9NS87 1388 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRN2-201ENST00000389413 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRN2-201ENST00000389413 MORC1Q86VD1 984 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRN2-201ENST00000389413 POGKQ9P215 609 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRN2-201ENST00000389413 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRN2-201ENST00000389413 USP47Q96K76 1375 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRN2-201ENST00000389413 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRN2-201ENST00000389413 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRN2-201ENST00000389413 NCOA2Q15596 1464 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRN2-201ENST00000389413 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PTPRN2-201ENST00000389413 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC7Q96M83 1385 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 GOLGA2Q08379 1002 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 TIAM1Q13009 1591 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 HMGXB3Q12766 1538 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-201ENST00000389413 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 GGT6Q6P531 493 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 PANK3Q9H999 370 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 CASC1Q6TDU7 716 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 KIF3BO15066 747 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRN2-201ENST00000389413 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 HFM1A2PYH4 1435 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.899e-7■■■■■ 147.6
PTPRN2-201ENST00000389413 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 PTPRGP23470 1445 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 C14orf37Q86TY3 774 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 HSCBQ8IWL3 235 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRN2-201ENST00000389413 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 27.2
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR97A6NE52 1622 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 STK26Q9P289 416 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 PDE4AP27815 886 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 PLIN1O60240 522 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 TOPBP1Q92547 1522 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 MIA2Q96PC5 1412 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRN2-201ENST00000389413 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRN2-201ENST00000389413 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRN2-201ENST00000389413 CRBNQ96SW2 442 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRN2-201ENST00000389413 MAP3K1Q13233 1512 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRN2-201ENST00000389413 GRIN2BQ13224 1484 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRN2-201ENST00000389413 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRN2-201ENST00000389413 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRN2-201ENST00000389413 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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