RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 CCER2I3L3R5 266 aa27.95■■■□□ 2.06
PAN3-201ENST00000380958 ANP32CO43423 234 aa27.95■■■□□ 2.06
PAN3-201ENST00000380958 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
PAN3-201ENST00000380958 KDM6BO15054 1643 aa27.93■■■□□ 2.06
PAN3-201ENST00000380958 NEFLP07196 543 aa27.91■■■□□ 2.06
PAN3-201ENST00000380958 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.91■■■□□ 2.06
PAN3-201ENST00000380958 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.9■■■□□ 2.06
PAN3-201ENST00000380958 CEP170Q5SW79 1584 aa27.9■■■□□ 2.06
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PAN3-201ENST00000380958 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.84■■■□□ 2.05
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PAN3-201ENST00000380958 ADGRL2O95490 1459 aa27.73■■■□□ 2.03
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PAN3-201ENST00000380958 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
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PAN3-201ENST00000380958 ABCA8O94911 1581 aa27.68■■■□□ 2.02
PAN3-201ENST00000380958 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.028e-12■■■■□ 25.3
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PAN3-201ENST00000380958 KIF14Q15058 1648 aa27.67■■■□□ 2.02
PAN3-201ENST00000380958 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PAN3-201ENST00000380958 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PAN3-201ENST00000380958 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.67■■■□□ 2.02
PAN3-201ENST00000380958 JPH4Q96JJ6 628 aa27.67■■■□□ 2.02
PAN3-201ENST00000380958 NCOA1Q15788 1441 aa27.66■■■□□ 2.02
PAN3-201ENST00000380958 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
PAN3-201ENST00000380958 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.64■■■□□ 2.02
PAN3-201ENST00000380958 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.61■■■□□ 2.01
PAN3-201ENST00000380958 PZPP20742 1482 aa27.61■■■□□ 2.01
PAN3-201ENST00000380958 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
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PAN3-201ENST00000380958 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.58■■■□□ 2.01
PAN3-201ENST00000380958 FBLN2P98095 1184 aa27.57■■■□□ 2
PAN3-201ENST00000380958 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.57■■■□□ 2
PAN3-201ENST00000380958 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.56■■■□□ 2
PAN3-201ENST00000380958 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.56■■■□□ 2
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PAN3-201ENST00000380958 FOXD1Q16676 465 aa27.54■■■□□ 2
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PAN3-201ENST00000380958 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.48■■□□□ 1.99
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PAN3-201ENST00000380958 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.44■■□□□ 1.98
PAN3-201ENST00000380958 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.44■■□□□ 1.98
PAN3-201ENST00000380958 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
PAN3-201ENST00000380958 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.42■■□□□ 1.98
PAN3-201ENST00000380958 PTPRGP23470 1445 aa27.37■■□□□ 1.97
PAN3-201ENST00000380958 PREX2Q70Z35 1606 aa27.35■■□□□ 1.97
PAN3-201ENST00000380958 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
PAN3-201ENST00000380958 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.35■■□□□ 1.97
PAN3-201ENST00000380958 MSH5O43196 834 aa27.34■■□□□ 1.97
PAN3-201ENST00000380958 TSPY4P0CV99 314 aa27.34■■□□□ 1.97
PAN3-201ENST00000380958 TSPY10P0CW01 314 aa27.34■■□□□ 1.97
PAN3-201ENST00000380958 PKD2Q13563 968 aa27.33■■□□□ 1.97
PAN3-201ENST00000380958 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.33■■□□□ 1.97
PAN3-201ENST00000380958 SHROOM2Q13796 1616 aa27.31■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.31■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.31■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.3■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.3■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 NUP155O75694 1391 aa27.29■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 CHD1O14646 1710 aa27.28■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.27■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.27■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 KIF15Q9NS87 1388 aa27.27■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.27■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 MRS2Q9HD23 443 aa27.27■■□□□ 1.96
PAN3-201ENST00000380958 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.26■■□□□ 1.95
PAN3-201ENST00000380958 KDM5CP41229 1560 aa27.26■■□□□ 1.95
PAN3-201ENST00000380958 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.24■■□□□ 1.95
PAN3-201ENST00000380958 USP47Q96K76 1375 aa27.24■■□□□ 1.95
PAN3-201ENST00000380958 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.22■■□□□ 1.95
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PAN3-201ENST00000380958 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
PAN3-201ENST00000380958 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.16■■□□□ 1.94
PAN3-201ENST00000380958 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.16■■□□□ 1.94
PAN3-201ENST00000380958 ABCC2Q92887 1545 aa27.16■■□□□ 1.94
PAN3-201ENST00000380958 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.944e-7■■■■■ 31.4
PAN3-201ENST00000380958 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.15■■□□□ 1.94
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