RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
PXDC1-202ENST00000380283 MIA2Q96PC5 1412 aa37.4■■■■□ 3.58
PXDC1-202ENST00000380283 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
PXDC1-202ENST00000380283 SIN3AQ96ST3 1273 aa37.39■■■■□ 3.58
PXDC1-202ENST00000380283 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.37■■■■□ 3.57
PXDC1-202ENST00000380283 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
PXDC1-202ENST00000380283 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.33■■■■□ 3.57
PXDC1-202ENST00000380283 CCER2I3L3R5 266 aa37.31■■■■□ 3.56
PXDC1-202ENST00000380283 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
PXDC1-202ENST00000380283 ANP32EQ9BTT0 268 aa37.3■■■■□ 3.56
PXDC1-202ENST00000380283 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
PXDC1-202ENST00000380283 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.26■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.26■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.26■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.24■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.23■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 FKBP8Q14318 412 aa37.23■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.22■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.2■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
PXDC1-202ENST00000380283 PTPRKQ15262 1439 aa37.17■■■■□ 3.54
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
PXDC1-202ENST00000380283 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.15■■■■□ 3.54
PXDC1-202ENST00000380283 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.12■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 ASXL2Q76L83 1435 aa37.12■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 BCANQ96GW7 911 aa37.12■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 ANP32CO43423 234 aa37.11■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.1■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 NEFLP07196 543 aa37.07■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.05■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 PREX2Q70Z35 1606 aa37.04■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.01■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 DAPK1P53355 1430 aa37.01■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 HFM1A2PYH4 1435 aa37■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 ABCC5O15440 1437 aa37■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.99■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 TONSLQ96HA7 1378 aa36.98■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 PLCH2O75038 1416 aa36.97■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.96■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 TRIM52Q96A61 297 aa36.93■■■■□ 3.5
PXDC1-202ENST00000380283 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.91■■■■□ 3.5
PXDC1-202ENST00000380283 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.9■■■■□ 3.5
PXDC1-202ENST00000380283 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.52e-6■■■□□ 18.1
PXDC1-202ENST00000380283 NAIPQ13075 1403 aa36.89■■■■□ 3.5
PXDC1-202ENST00000380283 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.88■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.87■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 AKNAQ7Z591 1439 aa36.84■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 MBD5Q9P267 1494 aa36.84■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 ROCK1Q13464 1354 aa36.83■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.81■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.79■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.78■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 TSPY4P0CV99 314 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 TSPY10P0CW01 314 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.76■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 NCOA1Q15788 1441 aa36.73■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.72■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.72■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.72■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.7■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 FANCAO15360 1455 aa36.7■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 ADGRL2O95490 1459 aa36.7■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.7■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 CD109Q6YHK3 1445 aa36.69■■■■□ 3.46
PXDC1-202ENST00000380283 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.68■■■■□ 3.46
PXDC1-202ENST00000380283 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.67■■■■□ 3.46
PXDC1-202ENST00000380283 ABCC1P33527 1531 aa36.66■■■■□ 3.46
PXDC1-202ENST00000380283 KDM6BO15054 1643 aa36.62■■■■□ 3.45
PXDC1-202ENST00000380283 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.58■■■■□ 3.45
PXDC1-202ENST00000380283 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 ADGRL1O94910 1474 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 GLI2P10070 1586 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 AFAP1Q8N556 730 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.52■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.52■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 ERICH6BQ5W0A0 696 aa36.51■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 KIF15Q9NS87 1388 aa36.5■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.49■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 DIP2BQ9P265 1576 aa36.48■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.48■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 FANCIQ9NVI1 1328 aa36.46■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.44■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.43■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 MSH5O43196 834 aa36.4■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 NEO1Q92859 1461 aa36.39■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.41
PXDC1-202ENST00000380283 PLXNC1O60486 1568 aa36.38■■■■□ 3.41
PXDC1-202ENST00000380283 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.37■■■■□ 3.41
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