RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PRRX1-202ENST00000367760 KDM6BO15054 1643 aa24.15■■□□□ 1.46
PRRX1-202ENST00000367760 ABCA8O94911 1581 aa24.14■■□□□ 1.46
PRRX1-202ENST00000367760 TRIM52Q96A61 297 aa24.14■■□□□ 1.45
PRRX1-202ENST00000367760 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PRRX1-202ENST00000367760 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-202ENST00000367760 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-202ENST00000367760 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-202ENST00000367760 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRX1-202ENST00000367760 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PRRX1-202ENST00000367760 KIF14Q15058 1648 aa24.07■■□□□ 1.44
PRRX1-202ENST00000367760 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.06■■□□□ 1.44
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PRRX1-202ENST00000367760 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PRRX1-202ENST00000367760 ADGRL2O95490 1459 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRX1-202ENST00000367760 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.03■■□□□ 1.44
PRRX1-202ENST00000367760 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.03■■□□□ 1.44
PRRX1-202ENST00000367760 ATP10BO94823 1461 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRX1-202ENST00000367760 NCOA1Q15788 1441 aa23.99■■□□□ 1.43
PRRX1-202ENST00000367760 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRX1-202ENST00000367760 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.97■■□□□ 1.43
PRRX1-202ENST00000367760 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PRRX1-202ENST00000367760 PTPRGP23470 1445 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRX1-202ENST00000367760 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRX1-202ENST00000367760 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.95■■□□□ 1.43
PRRX1-202ENST00000367760 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.95■■□□□ 1.42
PRRX1-202ENST00000367760 CCER2I3L3R5 266 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRX1-202ENST00000367760 CHD1O14646 1710 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRX1-202ENST00000367760 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PRRX1-202ENST00000367760 ANP32CO43423 234 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRX1-202ENST00000367760 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PRRX1-202ENST00000367760 SHROOM2Q13796 1616 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PRRX1-202ENST00000367760 PZPP20742 1482 aa23.89■■□□□ 1.41
PRRX1-202ENST00000367760 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.87■■□□□ 1.41
PRRX1-202ENST00000367760 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.86■■□□□ 1.41
PRRX1-202ENST00000367760 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.85■■□□□ 1.41
PRRX1-202ENST00000367760 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
PRRX1-202ENST00000367760 FOXD1Q16676 465 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRX1-202ENST00000367760 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRX1-202ENST00000367760 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRX1-202ENST00000367760 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.83■■□□□ 1.4
PRRX1-202ENST00000367760 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PRRX1-202ENST00000367760 PREX2Q70Z35 1606 aa23.79■■□□□ 1.4
PRRX1-202ENST00000367760 KCNH8Q96L42 1107 aa23.79■■□□□ 1.4
PRRX1-202ENST00000367760 TSPY4P0CV99 314 aa23.79■■□□□ 1.4
PRRX1-202ENST00000367760 TSPY10P0CW01 314 aa23.79■■□□□ 1.4
PRRX1-202ENST00000367760 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.77■■□□□ 1.4
PRRX1-202ENST00000367760 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.77■■□□□ 1.4
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.74■■□□□ 1.39
PRRX1-202ENST00000367760 MBD5Q9P267 1494 aa23.74■■□□□ 1.39
PRRX1-202ENST00000367760 ABCC2Q92887 1545 aa23.74■■□□□ 1.39
PRRX1-202ENST00000367760 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.73■■□□□ 1.39
PRRX1-202ENST00000367760 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.72■■□□□ 1.39
PRRX1-202ENST00000367760 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.72■■□□□ 1.39
PRRX1-202ENST00000367760 PKD2Q13563 968 aa23.7■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 KIF15Q9NS87 1388 aa23.7■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.68■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 NUP155O75694 1391 aa23.68■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.66■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.66■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC7Q96M83 1385 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.38
PRRX1-202ENST00000367760 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.64■■□□□ 1.37
PRRX1-202ENST00000367760 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.63■■□□□ 1.37
PRRX1-202ENST00000367760 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.63■■□□□ 1.37
PRRX1-202ENST00000367760 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.62■■□□□ 1.37
PRRX1-202ENST00000367760 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.62■■□□□ 1.37
PRRX1-202ENST00000367760 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PRRX1-202ENST00000367760 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.62■■□□□ 1.37
PRRX1-202ENST00000367760 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.6■■□□□ 1.37
PRRX1-202ENST00000367760 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.6■■□□□ 1.37
PRRX1-202ENST00000367760 PLXNC1O60486 1568 aa23.57■■□□□ 1.36
PRRX1-202ENST00000367760 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRX1-202ENST00000367760 UNC13BO14795 1591 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRX1-202ENST00000367760 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PRRX1-202ENST00000367760 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRX1-202ENST00000367760 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PRRX1-202ENST00000367760 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PRRX1-202ENST00000367760 PLCH2O75038 1416 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRX1-202ENST00000367760 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRX1-202ENST00000367760 USP47Q96K76 1375 aa23.5■■□□□ 1.35
PRRX1-202ENST00000367760 KDM5CP41229 1560 aa23.48■■□□□ 1.35
PRRX1-202ENST00000367760 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.48■■□□□ 1.35
PRRX1-202ENST00000367760 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 ERBINQ96RT1 1412 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 ABCC1P33527 1531 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.41■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.41■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PRRX1-202ENST00000367760 NEFLP07196 543 aa23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms