RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361201.8

CSAG4-201, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CSAG4, Length 755 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-201ENST00000361201 MAGI2Q86UL8 1455 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG4-201ENST00000361201 HECW1Q76N89 1606 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG4-201ENST00000361201 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG4-201ENST00000361201 NCOA1Q15788 1441 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG4-201ENST00000361201 HSPA1LP34931 641 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
CSAG4-201ENST00000361201 ATP10AO60312 1499 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG4-201ENST00000361201 P3H3Q8IVL6 736 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG4-201ENST00000361201 C3P01024 1663 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG4-201ENST00000361201 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
CSAG4-201ENST00000361201 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG4-201ENST00000361201 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG4-201ENST00000361201 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CSAG4-201ENST00000361201 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG4-201ENST00000361201 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG4-201ENST00000361201 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG4-201ENST00000361201 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CSAG4-201ENST00000361201 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CSAG4-201ENST00000361201 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG4-201ENST00000361201 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG4-201ENST00000361201 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG4-201ENST00000361201 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG4-201ENST00000361201 SAMD9Q5K651 1589 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG4-201ENST00000361201 PRXQ9BXM0 1461 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG4-201ENST00000361201 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CSAG4-201ENST00000361201 PLCH2O75038 1416 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG4-201ENST00000361201 PIP4K2BP78356 416 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG4-201ENST00000361201 ALKQ9UM73 1620 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG4-201ENST00000361201 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CSAG4-201ENST00000361201 REREQ9P2R6 1566 aa17■□□□□ 0.31
CSAG4-201ENST00000361201 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CSAG4-201ENST00000361201 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG4-201ENST00000361201 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CSAG4-201ENST00000361201 AFAP1Q8N556 730 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG4-201ENST00000361201 KDM5CP41229 1560 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG4-201ENST00000361201 AGLP35573 1532 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG4-201ENST00000361201 PLA2R1Q13018 1463 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG4-201ENST00000361201 NPATQ14207 1427 aa16.96■□□□□ 0.3
CSAG4-201ENST00000361201 TOM1O60784 492 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG4-201ENST00000361201 PKD2Q13563 968 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG4-201ENST00000361201 ABCA6Q8N139 1617 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG4-201ENST00000361201 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.9■□□□□ 0.3
CSAG4-201ENST00000361201 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.9■□□□□ 0.3
CSAG4-201ENST00000361201 ZMYM3Q14202 1370 aa16.89■□□□□ 0.3
CSAG4-201ENST00000361201 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.89■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.89■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 CPS1P31327 1500 aa16.87■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 POTEAQ6S8J7 498 aa16.87■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 MROH2AA6NES4 1674 aa16.87■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.86■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.85■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG4-201ENST00000361201 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG4-201ENST00000361201 PTPRKQ15262 1439 aa16.82■□□□□ 0.28
CSAG4-201ENST00000361201 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CSAG4-201ENST00000361201 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG4-201ENST00000361201 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG4-201ENST00000361201 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.79■□□□□ 0.28
CSAG4-201ENST00000361201 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CSAG4-201ENST00000361201 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.78■□□□□ 0.28
CSAG4-201ENST00000361201 KIF14Q15058 1648 aa16.78■□□□□ 0.28
CSAG4-201ENST00000361201 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
CSAG4-201ENST00000361201 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CSAG4-201ENST00000361201 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CSAG4-201ENST00000361201 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.74■□□□□ 0.27
CSAG4-201ENST00000361201 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.73■□□□□ 0.27
CSAG4-201ENST00000361201 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.72■□□□□ 0.27
CSAG4-201ENST00000361201 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CSAG4-201ENST00000361201 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CSAG4-201ENST00000361201 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.72■□□□□ 0.27
CSAG4-201ENST00000361201 ABCC1P33527 1531 aa16.7■□□□□ 0.26
CSAG4-201ENST00000361201 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.7■□□□□ 0.26
CSAG4-201ENST00000361201 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
CSAG4-201ENST00000361201 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.68■□□□□ 0.26
CSAG4-201ENST00000361201 MED14O60244 1454 aa16.65■□□□□ 0.26
CSAG4-201ENST00000361201 PLXNC1O60486 1568 aa16.64■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.63■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.6■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 PREX2Q70Z35 1606 aa16.59■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.59■□□□□ 0.25
CSAG4-201ENST00000361201 GGT6Q6P531 493 aa16.58■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 DEPDC5O75140 1603 aa16.58■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.56■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 SYNMO15061 1565 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 A2MP01023 1474 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 TNRQ92752 1358 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG4-201ENST00000361201 IQGAP1P46940 1657 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms