RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCA8O94911 1581 aa29.73■■■□□ 2.35
KCNQ1-202ENST00000335475 JPH4Q96JJ6 628 aa29.71■■■□□ 2.35
KCNQ1-202ENST00000335475 FBLN2P98095 1184 aa29.71■■■□□ 2.35
KCNQ1-202ENST00000335475 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.67■■■□□ 2.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
KCNQ1-202ENST00000335475 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.66■■■□□ 2.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.64■■■□□ 2.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM52Q96A61 297 aa29.6■■■□□ 2.33
KCNQ1-202ENST00000335475 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.59■■■□□ 2.33
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.58■■■□□ 2.33
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRL2O95490 1459 aa29.56■■■□□ 2.32
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP10BO94823 1461 aa29.55■■■□□ 2.32
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.55■■■□□ 2.32
KCNQ1-202ENST00000335475 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
KCNQ1-202ENST00000335475 CHD1O14646 1710 aa29.54■■■□□ 2.32
KCNQ1-202ENST00000335475 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
KCNQ1-202ENST00000335475 NCOA1Q15788 1441 aa29.49■■■□□ 2.31
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.49■■■□□ 2.31
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNH8Q96L42 1107 aa29.47■■■□□ 2.31
KCNQ1-202ENST00000335475 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
KCNQ1-202ENST00000335475 PZPP20742 1482 aa29.46■■■□□ 2.31
KCNQ1-202ENST00000335475 SHROOM2Q13796 1616 aa29.44■■■□□ 2.3
KCNQ1-202ENST00000335475 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.44■■■□□ 2.3
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXD1Q16676 465 aa29.42■■■□□ 2.3
KCNQ1-202ENST00000335475 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.42■■■□□ 2.3
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.39■■■□□ 2.3
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPRGP23470 1445 aa29.38■■■□□ 2.29
KCNQ1-202ENST00000335475 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.36■■■□□ 2.29
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.34■■■□□ 2.29
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KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.32■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 PREX2Q70Z35 1606 aa29.31■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 CCER2I3L3R5 266 aa29.3■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.3■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.3■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.28■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 ANP32CO43423 234 aa29.27■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.27■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.27■■■□□ 2.28
KCNQ1-202ENST00000335475 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.24■■■□□ 2.27
KCNQ1-202ENST00000335475 MBD5Q9P267 1494 aa29.24■■■□□ 2.27
KCNQ1-202ENST00000335475 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.23■■■□□ 2.27
KCNQ1-202ENST00000335475 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.23■■■□□ 2.27
KCNQ1-202ENST00000335475 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.22■■■□□ 2.27
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KCNQ1-202ENST00000335475 ABCC2Q92887 1545 aa29.19■■■□□ 2.26
KCNQ1-202ENST00000335475 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.18■■■□□ 2.26
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.16■■■□□ 2.26
KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.15■■■□□ 2.26
KCNQ1-202ENST00000335475 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.14■■■□□ 2.25
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KCNQ1-202ENST00000335475 PKD2Q13563 968 aa29.11■■■□□ 2.25
KCNQ1-202ENST00000335475 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.1■■■□□ 2.25
KCNQ1-202ENST00000335475 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
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KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC7Q96M83 1385 aa29.08■■■□□ 2.25
KCNQ1-202ENST00000335475 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.08■■■□□ 2.25
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KCNQ1-202ENST00000335475 TSPY10P0CW01 314 aa29.07■■■□□ 2.24
KCNQ1-202ENST00000335475 NUP155O75694 1391 aa29.06■■■□□ 2.24
KCNQ1-202ENST00000335475 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
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KCNQ1-202ENST00000335475 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.98■■■□□ 2.23
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KCNQ1-202ENST00000335475 KDM5CP41229 1560 aa28.97■■■□□ 2.23
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KCNQ1-202ENST00000335475 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.94■■■□□ 2.22
KCNQ1-202ENST00000335475 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.94■■■□□ 2.22
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KCNQ1-202ENST00000335475 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.81■■■□□ 2.2
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
KCNQ1-202ENST00000335475 PLA2R1Q13018 1463 aa28.77■■■□□ 2.2
KCNQ1-202ENST00000335475 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.76■■■□□ 2.19
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC184Q52MB2 194 aa28.76■■■□□ 2.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ERBINQ96RT1 1412 aa28.76■■■□□ 2.19
KCNQ1-202ENST00000335475 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.73■■■□□ 2.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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