RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
PPP1CC-201ENST00000335007 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.46■■□□□ 1.99
PPP1CC-201ENST00000335007 TOPBP1Q92547 1522 aa27.46■■□□□ 1.99
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.45■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.43■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 NUDCQ9Y266 331 aa27.43■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.43■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.43■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.43■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.42■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.41■■□□□ 1.98
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MIA2Q96PC5 1412 aa27.36■■□□□ 1.97
PPP1CC-201ENST00000335007 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-201ENST00000335007 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PPP1CC-201ENST00000335007 FOXD1Q16676 465 aa27.29■■□□□ 1.96
PPP1CC-201ENST00000335007 ROCK1Q13464 1354 aa27.25■■□□□ 1.95
PPP1CC-201ENST00000335007 NESP48681 1621 aa27.25■■□□□ 1.95
PPP1CC-201ENST00000335007 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PPP1CC-201ENST00000335007 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
PPP1CC-201ENST00000335007 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.2■■□□□ 1.94
PPP1CC-201ENST00000335007 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.18■■□□□ 1.94
PPP1CC-201ENST00000335007 DAPK1P53355 1430 aa27.18■■□□□ 1.94
PPP1CC-201ENST00000335007 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PPP1CC-201ENST00000335007 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
PPP1CC-201ENST00000335007 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.17■■□□□ 1.94
PPP1CC-201ENST00000335007 MBD5Q9P267 1494 aa27.15■■□□□ 1.94
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF14Q15058 1648 aa27.14■■□□□ 1.94
PPP1CC-201ENST00000335007 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 USP47Q96K76 1375 aa27.13■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 USP35Q9P2H5 1018 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM5CP41229 1560 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TMC1Q8TDI8 760 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 WDR62O43379 1518 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCC5O15440 1437 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 PZPP20742 1482 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 IQGAP2Q13576 1575 aa27.02■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF15Q9NS87 1388 aa27.02■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 MS4A1P11836 297 aa27.02■■□□□ 1.92
PPP1CC-201ENST00000335007 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 NEFMP07197 916 aa27.01■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 PDE4AP27815 886 aa27■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 IL27Q8NEV9 243 aa27■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.98■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 BACH2Q9BYV9 841 aa26.97■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.97■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.97■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
PPP1CC-201ENST00000335007 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 RALBP1Q15311 655 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 E9PCH4 1651 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 PDE3BQ13370 1112 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-201ENST00000335007 PBRM1Q86U86 1689 aa26.89■■□□□ 1.89
PPP1CC-201ENST00000335007 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP1CC-201ENST00000335007 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ARID3CA6NKF2 412 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP1CC-201ENST00000335007 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.82■■□□□ 1.88
PPP1CC-201ENST00000335007 ADGRL2O95490 1459 aa26.82■■□□□ 1.88
PPP1CC-201ENST00000335007 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP1CC-201ENST00000335007 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP1CC-201ENST00000335007 ADAMTS12P58397 1594 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CC-201ENST00000335007 PKD2Q13563 968 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP1CC-201ENST00000335007 NLRP13Q86W25 1043 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP1CC-201ENST00000335007 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-201ENST00000335007 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA0556O60303 1618 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GSE1Q14687 1217 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-201ENST00000335007 INSRP06213 1382 aa26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms