RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
SNX18-201ENST00000326277 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.96■■■□□ 2.87
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.96■■■□□ 2.87
SNX18-201ENST00000326277 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.86
SNX18-201ENST00000326277 SHROOM2Q13796 1616 aa32.94■■■□□ 2.86
SNX18-201ENST00000326277 TRIM52Q96A61 297 aa32.92■■■□□ 2.86
SNX18-201ENST00000326277 TONSLQ96HA7 1378 aa32.91■■■□□ 2.86
SNX18-201ENST00000326277 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
SNX18-201ENST00000326277 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
SNX18-201ENST00000326277 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.87■■■□□ 2.85
SNX18-201ENST00000326277 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
SNX18-201ENST00000326277 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
SNX18-201ENST00000326277 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.84■■■□□ 2.85
SNX18-201ENST00000326277 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.82■■■□□ 2.84
SNX18-201ENST00000326277 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
SNX18-201ENST00000326277 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.78■■■□□ 2.84
SNX18-201ENST00000326277 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.78■■■□□ 2.84
SNX18-201ENST00000326277 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.77■■■□□ 2.84
SNX18-201ENST00000326277 NCOA1Q15788 1441 aa32.76■■■□□ 2.83
SNX18-201ENST00000326277 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
SNX18-201ENST00000326277 ADGRL2O95490 1459 aa32.73■■■□□ 2.83
SNX18-201ENST00000326277 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.73■■■□□ 2.83
SNX18-201ENST00000326277 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.7■■■□□ 2.83
SNX18-201ENST00000326277 FOXD1Q16676 465 aa32.67■■■□□ 2.82
SNX18-201ENST00000326277 ABCC2Q92887 1545 aa32.66■■■□□ 2.82
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.65■■■□□ 2.82
SNX18-201ENST00000326277 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.62■■■□□ 2.81
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.61■■■□□ 2.81
SNX18-201ENST00000326277 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
SNX18-201ENST00000326277 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
SNX18-201ENST00000326277 PREX2Q70Z35 1606 aa32.59■■■□□ 2.81
SNX18-201ENST00000326277 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.59■■■□□ 2.81
SNX18-201ENST00000326277 PZPP20742 1482 aa32.58■■■□□ 2.81
SNX18-201ENST00000326277 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.58■■■□□ 2.81
SNX18-201ENST00000326277 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.55■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.54■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.54■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.54■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 MBD5Q9P267 1494 aa32.53■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.52■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 TSPY4P0CV99 314 aa32.51■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 TSPY10P0CW01 314 aa32.51■■■□□ 2.8
SNX18-201ENST00000326277 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.51■■■□□ 2.79
SNX18-201ENST00000326277 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.49■■■□□ 2.79
SNX18-201ENST00000326277 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.46■■■□□ 2.79
SNX18-201ENST00000326277 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.45■■■□□ 2.78
SNX18-201ENST00000326277 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
SNX18-201ENST00000326277 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.43■■■□□ 2.78
SNX18-201ENST00000326277 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.42■■■□□ 2.78
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.41■■■□□ 2.78
SNX18-201ENST00000326277 KIF15Q9NS87 1388 aa32.41■■■□□ 2.78
SNX18-201ENST00000326277 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa32.4■■■□□ 2.78
SNX18-201ENST00000326277 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.39■■■□□ 2.78
SNX18-201ENST00000326277 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.39■■■□□ 2.78
SNX18-201ENST00000326277 KCNH8Q96L42 1107 aa32.38■■■□□ 2.77
SNX18-201ENST00000326277 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.38■■■□□ 2.77
SNX18-201ENST00000326277 PKD2Q13563 968 aa32.36■■■□□ 2.77
SNX18-201ENST00000326277 NUP155O75694 1391 aa32.35■■■□□ 2.77
SNX18-201ENST00000326277 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.32■■■□□ 2.77
SNX18-201ENST00000326277 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
SNX18-201ENST00000326277 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.29■■■□□ 2.76
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.28■■■□□ 2.76
SNX18-201ENST00000326277 NBPF8Q3BBV2 869 aa32.28■■■□□ 2.76
SNX18-201ENST00000326277 PLCH2O75038 1416 aa32.27■■■□□ 2.76
SNX18-201ENST00000326277 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.75
SNX18-201ENST00000326277 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.22■■■□□ 2.75
SNX18-201ENST00000326277 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.17■■■□□ 2.74
SNX18-201ENST00000326277 PLXNC1O60486 1568 aa32.17■■■□□ 2.74
SNX18-201ENST00000326277 ANP32CO43423 234 aa32.16■■■□□ 2.74
SNX18-201ENST00000326277 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.15■■■□□ 2.74
SNX18-201ENST00000326277 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.14■■■□□ 2.74
SNX18-201ENST00000326277 ABCC1P33527 1531 aa32.12■■■□□ 2.73
SNX18-201ENST00000326277 UNC13BO14795 1591 aa32.1■■■□□ 2.73
SNX18-201ENST00000326277 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.1■■■□□ 2.73
SNX18-201ENST00000326277 CCER2I3L3R5 266 aa32.07■■■□□ 2.73
SNX18-201ENST00000326277 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.07■■■□□ 2.72
SNX18-201ENST00000326277 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.07■■■□□ 2.72
SNX18-201ENST00000326277 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.06■■■□□ 2.72
SNX18-201ENST00000326277 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.05■■■□□ 2.72
SNX18-201ENST00000326277 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
SNX18-201ENST00000326277 OSCARQ8IYS5 282 aa32.02■■■□□ 2.72
SNX18-201ENST00000326277 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
SNX18-201ENST00000326277 ERBINQ96RT1 1412 aa32■■■□□ 2.71
SNX18-201ENST00000326277 CCDC7Q96M83 1385 aa31.99■■■□□ 2.71
SNX18-201ENST00000326277 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.99■■■□□ 2.71
SNX18-201ENST00000326277 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.99■■■□□ 2.71
SNX18-201ENST00000326277 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.98■■■□□ 2.71
SNX18-201ENST00000326277 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.96■■■□□ 2.71
SNX18-201ENST00000326277 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.94■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 ASXL2Q76L83 1435 aa31.93■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.93■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 AFAP1Q8N556 730 aa31.91■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 FANCAO15360 1455 aa31.91■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.9■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.9■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 USP47Q96K76 1375 aa31.9■■■□□ 2.7
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