RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319331.3

LRRN1-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN1, Length 3,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-201ENST00000319331 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.66■□□□□ 0.74
LRRN1-201ENST00000319331 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.65■□□□□ 0.74
LRRN1-201ENST00000319331 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.64■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 GSE1Q14687 1217 aa19.63■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.63■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.62■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 TOP2BQ02880 1626 aa19.62■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 UACAQ9BZF9 1416 aa19.6■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 PKD2Q13563 968 aa19.59■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
LRRN1-201ENST00000319331 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.58■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 CRBNQ96SW2 442 aa19.58■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.58■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.57■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 NFKBIBQ15653 356 aa19.56■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 USP35Q9P2H5 1018 aa19.56■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 NEUROD2Q15784 382 aa19.55■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.55■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.54■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.54■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.54■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa19.53■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
LRRN1-201ENST00000319331 TIAM1Q13009 1591 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRN1-201ENST00000319331 TSPY4P0CV99 314 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRN1-201ENST00000319331 TSPY10P0CW01 314 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRN1-201ENST00000319331 BECN1Q14457 450 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRN1-201ENST00000319331 BACH2Q9BYV9 841 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRN1-201ENST00000319331 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
LRRN1-201ENST00000319331 USP47Q96K76 1375 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRN1-201ENST00000319331 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
LRRN1-201ENST00000319331 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 NLRP13Q86W25 1043 aa19.44■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.42■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 RALBP1Q15311 655 aa19.42■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.42■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 ERCC6Q03468 1493 aa19.41■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.41■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 MS4A1P11836 297 aa19.4■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 TOPBP1Q92547 1522 aa19.4■□□□□ 0.7
LRRN1-201ENST00000319331 NAIPQ13075 1403 aa19.39■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 HFM1A2PYH4 1435 aa19.38■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 FAM161AQ3B820 660 aa19.37■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.36■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 KIF15Q9NS87 1388 aa19.36■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 PTPRKQ15262 1439 aa19.35■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 NCOA2Q15596 1464 aa19.34■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 PDE3BQ13370 1112 aa19.33■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 NUP155O75694 1391 aa19.33■□□□□ 0.69
LRRN1-201ENST00000319331 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.32■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.31■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.31■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 PANK3Q9H999 370 aa19.31■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.3■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.3■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.29■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.28■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA2Q08379 1002 aa19.28■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 ARID3AQ99856 593 aa19.28■□□□□ 0.68
LRRN1-201ENST00000319331 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 NCOA1Q15788 1441 aa19.26■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 TMF1P82094 1093 aa19.26■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.25■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 COG6Q9Y2V7 657 aa19.23■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.23■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.23■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.22■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 POGKQ9P215 609 aa19.22■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.21■□□□□ 0.67
LRRN1-201ENST00000319331 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.2■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.19■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 APAF1O14727 1248 aa19.19■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.19■□□□□ 0.66
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