RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299575.4

ATMIN-201, Transcript of ATM interactor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATMIN, Length 4,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMIN-201ENST00000299575 MORC1Q86VD1 984 aa29.34■■■□□ 2.29
ATMIN-201ENST00000299575 MLECQ14165 292 aa29.32■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.32■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 RALBP1Q15311 655 aa29.3■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.3■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 MS4A1P11836 297 aa29.27■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 KIF3BO15066 747 aa29.27■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 NCAPD3P42695 1498 aa29.26■■■□□ 2.28
ATMIN-201ENST00000299575 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
ATMIN-201ENST00000299575 A0A0G2JS52 829 aa29.23■■■□□ 2.27
ATMIN-201ENST00000299575 STK26Q9P289 416 aa29.22■■■□□ 2.27
ATMIN-201ENST00000299575 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ATMIN-201ENST00000299575 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.2■■■□□ 2.27
ATMIN-201ENST00000299575 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
ATMIN-201ENST00000299575 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.19■■■□□ 2.26
ATMIN-201ENST00000299575 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.19■■■□□ 2.26
ATMIN-201ENST00000299575 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.18■■■□□ 2.26
ATMIN-201ENST00000299575 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.14■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 KIF21BO75037 1637 aa29.13■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 GOLGA6L22H0YM25 854 aa29.12■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 CASC1Q6TDU7 716 aa29.12■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 NLRP13Q86W25 1043 aa29.1■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 PTPRGP23470 1445 aa29.09■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ATMIN-201ENST00000299575 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.07■■■□□ 2.24
ATMIN-201ENST00000299575 SOX12O15370 315 aa29.07■■■□□ 2.24
ATMIN-201ENST00000299575 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
ATMIN-201ENST00000299575 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
ATMIN-201ENST00000299575 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
ATMIN-201ENST00000299575 NCLP19338 710 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ATMIN-201ENST00000299575 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.03■■■□□ 2.24
ATMIN-201ENST00000299575 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.02■■■□□ 2.24
ATMIN-201ENST00000299575 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.01■■■□□ 2.24
ATMIN-201ENST00000299575 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29■■■□□ 2.23
ATMIN-201ENST00000299575 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.97■■■□□ 2.23
ATMIN-201ENST00000299575 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.97■■■□□ 2.23
ATMIN-201ENST00000299575 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
ATMIN-201ENST00000299575 SYNJ1O43426 1573 aa28.95■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 CFTRP13569 1480 aa28.94■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 KIF15Q9NS87 1388 aa28.94■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 PDE3BQ13370 1112 aa28.94■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.92■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 GOLGA2Q08379 1002 aa28.92■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 ARAP1Q96P48 1450 aa28.9■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 USP47Q96K76 1375 aa28.9■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
ATMIN-201ENST00000299575 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.89■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 PANK3Q9H999 370 aa28.88■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.88■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.87■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 CUX1P39880 1505 aa28.86■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 UACAQ9BZF9 1416 aa28.86■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.83■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.83■■■□□ 2.21
ATMIN-201ENST00000299575 PRXQ9BXM0 1461 aa28.8■■■□□ 2.2
ATMIN-201ENST00000299575 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
ATMIN-201ENST00000299575 NCOA2Q15596 1464 aa28.79■■■□□ 2.2
ATMIN-201ENST00000299575 HSCBQ8IWL3 235 aa28.76■■■□□ 2.2
ATMIN-201ENST00000299575 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.76■■■□□ 2.19
ATMIN-201ENST00000299575 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
ATMIN-201ENST00000299575 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.75■■■□□ 2.19
ATMIN-201ENST00000299575 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.73■■■□□ 2.19
ATMIN-201ENST00000299575 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ATMIN-201ENST00000299575 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.71■■■□□ 2.19
ATMIN-201ENST00000299575 TOP2BQ02880 1626 aa28.71■■■□□ 2.19
ATMIN-201ENST00000299575 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
ATMIN-201ENST00000299575 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
ATMIN-201ENST00000299575 GRIN2BQ13224 1484 aa28.7■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 KCNJ4P48050 445 aa28.7■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.69■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.68■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.68■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.68■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 CFAP44Q96MT7 982 aa28.68■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 APBB1O00213 710 aa28.66■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 NESP48681 1621 aa28.66■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 HMGXB3Q12766 1538 aa28.65■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 PTMAP06454 111 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 CCDC7Q96M83 1385 aa28.65■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 EID1Q9Y6B2 187 aa28.65■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.64■■■□□ 2.18
ATMIN-201ENST00000299575 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa28.63■■■□□ 2.17
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