RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287667.11

NOMO1-201, Transcript of NODAL modulator 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO1, Length 4,355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO1-201ENST00000287667 ARAP1Q96P48 1450 aa23.76■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.75■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.74■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 NLRP13Q86W25 1043 aa23.73■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 PLEKHG5O94827 1062 aa23.73■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 ERCC6Q03468 1493 aa23.73■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
NOMO1-201ENST00000287667 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.7■■□□□ 1.38
NOMO1-201ENST00000287667 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.69■■□□□ 1.38
NOMO1-201ENST00000287667 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.69■■□□□ 1.38
NOMO1-201ENST00000287667 MORC1Q86VD1 984 aa23.68■■□□□ 1.38
NOMO1-201ENST00000287667 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
NOMO1-201ENST00000287667 PLIN1O60240 522 aa23.67■■□□□ 1.38
NOMO1-201ENST00000287667 POGKQ9P215 609 aa23.67■■□□□ 1.38
NOMO1-201ENST00000287667 SYNJ1O43426 1573 aa23.67■■□□□ 1.38
NOMO1-201ENST00000287667 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.64■■□□□ 1.38
NOMO1-201ENST00000287667 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.64■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.63■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.63■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.63■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.62■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.61■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.61■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.61■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.6■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.6■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 USP47Q96K76 1375 aa23.6■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 GGT6Q6P531 493 aa23.59■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 GOLGA2Q08379 1002 aa23.58■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.58■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 PANK3Q9H999 370 aa23.58■■□□□ 1.37
NOMO1-201ENST00000287667 JPH4Q96JJ6 628 aa23.57■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 C14orf37Q86TY3 774 aa23.57■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.56■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 PDE3BQ13370 1112 aa23.56■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.56■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 UACAQ9BZF9 1416 aa23.56■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.55■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 CCDC7Q96M83 1385 aa23.55■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 KIF15Q9NS87 1388 aa23.55■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 STK26Q9P289 416 aa23.55■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 PDE4AP27815 886 aa23.54■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 SLC4A3P48751 1232 aa23.54■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NOMO1-201ENST00000287667 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.51■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 KANK1Q14678 1352 aa23.51■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 MS4A1P11836 297 aa23.5■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 PRXQ9BXM0 1461 aa23.5■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.5■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 KIF3BO15066 747 aa23.49■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 CCDC184Q52MB2 194 aa23.47■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 CRBNQ96SW2 442 aa23.47■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 SOX12O15370 315 aa23.46■■□□□ 1.35
NOMO1-201ENST00000287667 HSCBQ8IWL3 235 aa23.45■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.42■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.42■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.41■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.41■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.4■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 APBB1O00213 710 aa23.4■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 CASC1Q6TDU7 716 aa23.4■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.4■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NOMO1-201ENST00000287667 NCOA2Q15596 1464 aa23.39■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 NCAPD3P42695 1498 aa23.38■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.38■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 ARID3AQ99856 593 aa23.38■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.38■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.37■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 WDR97A6NE52 1622 aa23.37■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 APAF1O14727 1248 aa23.37■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.37■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 MLECQ14165 292 aa23.36■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.35■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
NOMO1-201ENST00000287667 CFTRP13569 1480 aa23.33■■□□□ 1.32
NOMO1-201ENST00000287667 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.32■■□□□ 1.32
NOMO1-201ENST00000287667 PLCB2Q00722 1185 aa23.31■■□□□ 1.32
NOMO1-201ENST00000287667 COG6Q9Y2V7 657 aa23.31■■□□□ 1.32
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