RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283172.8

RASSF3-201, Transcript of Ras association domain family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene RASSF3, Length 1,099 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3-201ENST00000283172 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.57■■■□□ 2
RASSF3-201ENST00000283172 HECW1Q76N89 1606 aa27.56■■■□□ 2
RASSF3-201ENST00000283172 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
RASSF3-201ENST00000283172 STRCQ7RTU9 1775 aa27.54■■■□□ 2
RASSF3-201ENST00000283172 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.54■■■□□ 2
RASSF3-201ENST00000283172 ATP10AO60312 1499 aa27.52■■■□□ 2
RASSF3-201ENST00000283172 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.51■■□□□ 1.99
RASSF3-201ENST00000283172 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.51■■□□□ 1.99
RASSF3-201ENST00000283172 PTPRTO14522 1441 aa27.47■■□□□ 1.99
RASSF3-201ENST00000283172 PLCH2O75038 1416 aa27.47■■□□□ 1.99
RASSF3-201ENST00000283172 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.47■■□□□ 1.99
RASSF3-201ENST00000283172 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.44■■□□□ 1.98
RASSF3-201ENST00000283172 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.44■■□□□ 1.98
RASSF3-201ENST00000283172 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
RASSF3-201ENST00000283172 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.39■■□□□ 1.98
RASSF3-201ENST00000283172 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.38■■□□□ 1.97
RASSF3-201ENST00000283172 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.35■■□□□ 1.97
RASSF3-201ENST00000283172 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
RASSF3-201ENST00000283172 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
RASSF3-201ENST00000283172 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.28■■□□□ 1.96
RASSF3-201ENST00000283172 AFAP1Q8N556 730 aa27.27■■□□□ 1.96
RASSF3-201ENST00000283172 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.25■■□□□ 1.95
RASSF3-201ENST00000283172 KDM5CP41229 1560 aa27.25■■□□□ 1.95
RASSF3-201ENST00000283172 NCOA1Q15788 1441 aa27.24■■□□□ 1.95
RASSF3-201ENST00000283172 REREQ9P2R6 1566 aa27.24■■□□□ 1.95
RASSF3-201ENST00000283172 C3P01024 1663 aa27.2■■□□□ 1.94
RASSF3-201ENST00000283172 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.19■■□□□ 1.94
RASSF3-201ENST00000283172 AGLP35573 1532 aa27.17■■□□□ 1.94
RASSF3-201ENST00000283172 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.17■■□□□ 1.94
RASSF3-201ENST00000283172 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.16■■□□□ 1.94
RASSF3-201ENST00000283172 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 EEA1Q15075 1411 aa27.11■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.11■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.11■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.11■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.09■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 ABCA6Q8N139 1617 aa27.08■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 KIF14Q15058 1648 aa27.08■■□□□ 1.93
RASSF3-201ENST00000283172 NPATQ14207 1427 aa27.07■■□□□ 1.92
RASSF3-201ENST00000283172 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.07■■□□□ 1.92
RASSF3-201ENST00000283172 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
RASSF3-201ENST00000283172 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.05■■□□□ 1.92
RASSF3-201ENST00000283172 FMN1Q68DA7 1419 aa27.03■■□□□ 1.92
RASSF3-201ENST00000283172 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
RASSF3-201ENST00000283172 ZMYM3Q14202 1370 aa27■■□□□ 1.91
RASSF3-201ENST00000283172 PKD2Q13563 968 aa27■■□□□ 1.91
RASSF3-201ENST00000283172 PLA2R1Q13018 1463 aa26.97■■□□□ 1.91
RASSF3-201ENST00000283172 CLIP1P30622 1438 aa26.97■■□□□ 1.91
RASSF3-201ENST00000283172 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.95■■□□□ 1.9
RASSF3-201ENST00000283172 ABCC1P33527 1531 aa26.95■■□□□ 1.9
RASSF3-201ENST00000283172 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
RASSF3-201ENST00000283172 MROH2AA6NES4 1674 aa26.93■■□□□ 1.9
RASSF3-201ENST00000283172 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.93■■□□□ 1.9
RASSF3-201ENST00000283172 HSPA1LP34931 641 aa26.91■■□□□ 1.9
RASSF3-201ENST00000283172 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.9■■□□□ 1.9
RASSF3-201ENST00000283172 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
RASSF3-201ENST00000283172 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.86■■□□□ 1.89
RASSF3-201ENST00000283172 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.86■■□□□ 1.89
RASSF3-201ENST00000283172 PREX2Q70Z35 1606 aa26.86■■□□□ 1.89
RASSF3-201ENST00000283172 PTPRKQ15262 1439 aa26.85■■□□□ 1.89
RASSF3-201ENST00000283172 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
RASSF3-201ENST00000283172 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
RASSF3-201ENST00000283172 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.81■■□□□ 1.88
RASSF3-201ENST00000283172 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.8■■□□□ 1.88
RASSF3-201ENST00000283172 TOM1O60784 492 aa26.8■■□□□ 1.88
RASSF3-201ENST00000283172 PIP4K2BP78356 416 aa26.79■■□□□ 1.88
RASSF3-201ENST00000283172 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.78■■□□□ 1.88
RASSF3-201ENST00000283172 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
RASSF3-201ENST00000283172 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
RASSF3-201ENST00000283172 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
RASSF3-201ENST00000283172 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
RASSF3-201ENST00000283172 PLXNC1O60486 1568 aa26.73■■□□□ 1.87
RASSF3-201ENST00000283172 CPS1P31327 1500 aa26.73■■□□□ 1.87
RASSF3-201ENST00000283172 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.71■■□□□ 1.87
RASSF3-201ENST00000283172 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
RASSF3-201ENST00000283172 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.7■■□□□ 1.87
RASSF3-201ENST00000283172 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 A2MP01023 1474 aa26.69■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.69■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 GGT6Q6P531 493 aa26.69■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.68■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.67■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.66■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.66■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 ATP7AQ04656 1500 aa26.66■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.64■■□□□ 1.86
RASSF3-201ENST00000283172 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.63■■□□□ 1.85
RASSF3-201ENST00000283172 ALKQ9UM73 1620 aa26.63■■□□□ 1.85
RASSF3-201ENST00000283172 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
RASSF3-201ENST00000283172 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.57■■□□□ 1.84
RASSF3-201ENST00000283172 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.57■■□□□ 1.84
RASSF3-201ENST00000283172 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
RASSF3-201ENST00000283172 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.55■■□□□ 1.84
RASSF3-201ENST00000283172 TNRQ92752 1358 aa26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms