RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.03■■■□□ 2.08
USP12-201ENST00000282344 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.02■■■□□ 2.08
USP12-201ENST00000282344 NLRP13Q86W25 1043 aa28.02■■■□□ 2.08
USP12-201ENST00000282344 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.01■■■□□ 2.08
USP12-201ENST00000282344 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.01■■■□□ 2.07
USP12-201ENST00000282344 ERCC6Q03468 1493 aa27.98■■■□□ 2.07
USP12-201ENST00000282344 MORC1Q86VD1 984 aa27.97■■■□□ 2.07
USP12-201ENST00000282344 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.078e-6■□□□□ 11.3
USP12-201ENST00000282344 PLEKHG5O94827 1062 aa27.97■■■□□ 2.07
USP12-201ENST00000282344 POGKQ9P215 609 aa27.97■■■□□ 2.07
USP12-201ENST00000282344 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.96■■■□□ 2.07
USP12-201ENST00000282344 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.95■■■□□ 2.07
USP12-201ENST00000282344 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
USP12-201ENST00000282344 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.94■■■□□ 2.06
USP12-201ENST00000282344 ARAP1Q96P48 1450 aa27.89■■■□□ 2.06
USP12-201ENST00000282344 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 MS4A1P11836 297 aa27.87■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.87■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 C14orf37Q86TY3 774 aa27.86■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 PLIN1O60240 522 aa27.86■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 PDE3BQ13370 1112 aa27.86■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.86■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 GOLGA2Q08379 1002 aa27.85■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.85■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.85■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.85■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
USP12-201ENST00000282344 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.82■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 USP47Q96K76 1375 aa27.82■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.81■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 KIF15Q9NS87 1388 aa27.81■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 KANK1Q14678 1352 aa27.81■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.81■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 GGT6Q6P531 493 aa27.8■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.79■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 PANK3Q9H999 370 aa27.78■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 HSCBQ8IWL3 235 aa27.78■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 PDE4AP27815 886 aa27.78■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.77■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.77■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.77■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 SYNJ1O43426 1573 aa27.77■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 CASC1Q6TDU7 716 aa27.77■■■□□ 2.04
USP12-201ENST00000282344 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.76■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 UACAQ9BZF9 1416 aa27.76■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 STK26Q9P289 416 aa27.75■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 CCDC7Q96M83 1385 aa27.74■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.74■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 JPH4Q96JJ6 628 aa27.73■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 SLC4A3P48751 1232 aa27.72■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.71■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
USP12-201ENST00000282344 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.68■■■□□ 2.02
USP12-201ENST00000282344 KIF3BO15066 747 aa27.68■■■□□ 2.02
USP12-201ENST00000282344 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
USP12-201ENST00000282344 CRBNQ96SW2 442 aa27.67■■■□□ 2.02
USP12-201ENST00000282344 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
USP12-201ENST00000282344 SOX12O15370 315 aa27.66■■■□□ 2.02
USP12-201ENST00000282344 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.65■■■□□ 2.02
USP12-201ENST00000282344 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
USP12-201ENST00000282344 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.63■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 APBB1O00213 710 aa27.62■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.61■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.61■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 PRXQ9BXM0 1461 aa27.61■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 PLCB2Q00722 1185 aa27.59■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.58■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.58■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.58■■■□□ 2.01
USP12-201ENST00000282344 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.57■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 APAF1O14727 1248 aa27.54■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 CCDC184Q52MB2 194 aa27.53■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.53■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 NCOA2Q15596 1464 aa27.53■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 MLECQ14165 292 aa27.53■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 FAM161AQ3B820 660 aa27.53■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.53■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.52■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
USP12-201ENST00000282344 USP35Q9P2H5 1018 aa27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms