RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262498.7

CFAP20-201, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFAP20, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-201ENST00000262498 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.4■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 MLECQ14165 292 aa20.35■□□□□ 0.85
CFAP20-201ENST00000262498 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.34■□□□□ 0.85
CFAP20-201ENST00000262498 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CFAP20-201ENST00000262498 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.31■□□□□ 0.84
CFAP20-201ENST00000262498 ATP10AO60312 1499 aa20.3■□□□□ 0.84
CFAP20-201ENST00000262498 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.3■□□□□ 0.84
CFAP20-201ENST00000262498 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CFAP20-201ENST00000262498 PLCH2O75038 1416 aa20.28■□□□□ 0.84
CFAP20-201ENST00000262498 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.28■□□□□ 0.84
CFAP20-201ENST00000262498 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CFAP20-201ENST00000262498 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.26■□□□□ 0.83
CFAP20-201ENST00000262498 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.25■□□□□ 0.83
CFAP20-201ENST00000262498 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.23■□□□□ 0.83
CFAP20-201ENST00000262498 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.22■□□□□ 0.83
CFAP20-201ENST00000262498 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.22■□□□□ 0.83
CFAP20-201ENST00000262498 C3P01024 1663 aa20.22■□□□□ 0.83
CFAP20-201ENST00000262498 KDM5CP41229 1560 aa20.22■□□□□ 0.83
CFAP20-201ENST00000262498 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CFAP20-201ENST00000262498 PTPRTO14522 1441 aa20.21■□□□□ 0.83
CFAP20-201ENST00000262498 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.19■□□□□ 0.82
CFAP20-201ENST00000262498 REREQ9P2R6 1566 aa20.17■□□□□ 0.82
CFAP20-201ENST00000262498 KIF14Q15058 1648 aa20.17■□□□□ 0.82
CFAP20-201ENST00000262498 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.16■□□□□ 0.82
CFAP20-201ENST00000262498 ABCA6Q8N139 1617 aa20.15■□□□□ 0.82
CFAP20-201ENST00000262498 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.14■□□□□ 0.82
CFAP20-201ENST00000262498 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.12■□□□□ 0.81
CFAP20-201ENST00000262498 AFAP1Q8N556 730 aa20.12■□□□□ 0.81
CFAP20-201ENST00000262498 NCOA1Q15788 1441 aa20.1■□□□□ 0.81
CFAP20-201ENST00000262498 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.1■□□□□ 0.81
CFAP20-201ENST00000262498 AGLP35573 1532 aa20.09■□□□□ 0.81
CFAP20-201ENST00000262498 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.08■□□□□ 0.81
CFAP20-201ENST00000262498 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.07■□□□□ 0.8
CFAP20-201ENST00000262498 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.07■□□□□ 0.8
CFAP20-201ENST00000262498 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.06■□□□□ 0.8
CFAP20-201ENST00000262498 EEA1Q15075 1411 aa20.06■□□□□ 0.8
CFAP20-201ENST00000262498 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.04■□□□□ 0.8
CFAP20-201ENST00000262498 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.02■□□□□ 0.8
CFAP20-201ENST00000262498 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CFAP20-201ENST00000262498 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20■□□□□ 0.79
CFAP20-201ENST00000262498 ABCC1P33527 1531 aa20■□□□□ 0.79
CFAP20-201ENST00000262498 MROH2AA6NES4 1674 aa20■□□□□ 0.79
CFAP20-201ENST00000262498 PREX2Q70Z35 1606 aa19.99■□□□□ 0.79
CFAP20-201ENST00000262498 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.98■□□□□ 0.79
CFAP20-201ENST00000262498 FMN1Q68DA7 1419 aa19.98■□□□□ 0.79
CFAP20-201ENST00000262498 NPATQ14207 1427 aa19.96■□□□□ 0.79
CFAP20-201ENST00000262498 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.96■□□□□ 0.79
CFAP20-201ENST00000262498 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CFAP20-201ENST00000262498 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.93■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.92■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.92■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 MYO3AQ8NEV4 1616 aa19.91■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 CLIP1P30622 1438 aa19.9■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 UBAP1LF5GYI3 381 aa19.9■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 PLA2R1Q13018 1463 aa19.89■□□□□ 0.78
CFAP20-201ENST00000262498 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.89■□□□□ 0.77
CFAP20-201ENST00000262498 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CFAP20-201ENST00000262498 ZMYM3Q14202 1370 aa19.89■□□□□ 0.77
CFAP20-201ENST00000262498 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CFAP20-201ENST00000262498 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CFAP20-201ENST00000262498 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CFAP20-201ENST00000262498 PLXNC1O60486 1568 aa19.85■□□□□ 0.77
CFAP20-201ENST00000262498 PTPRKQ15262 1439 aa19.83■□□□□ 0.76
CFAP20-201ENST00000262498 PKD2Q13563 968 aa19.82■□□□□ 0.76
CFAP20-201ENST00000262498 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.8■□□□□ 0.76
CFAP20-201ENST00000262498 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
CFAP20-201ENST00000262498 HSPA1LP34931 641 aa19.79■□□□□ 0.76
CFAP20-201ENST00000262498 ATP7AQ04656 1500 aa19.78■□□□□ 0.76
CFAP20-201ENST00000262498 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.77■□□□□ 0.76
CFAP20-201ENST00000262498 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
CFAP20-201ENST00000262498 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.76■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 ALKQ9UM73 1620 aa19.76■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.76■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.75■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.75■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.74■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 A2MP01023 1474 aa19.73■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 A2ML1A8K2U0 1454 aa19.72■□□□□ 0.75
CFAP20-201ENST00000262498 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.759e-6■■■■□ 22.2
CFAP20-201ENST00000262498 CPS1P31327 1500 aa19.7■□□□□ 0.74
CFAP20-201ENST00000262498 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.69■□□□□ 0.74
CFAP20-201ENST00000262498 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CFAP20-201ENST00000262498 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.69■□□□□ 0.74
CFAP20-201ENST00000262498 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.68■□□□□ 0.74
CFAP20-201ENST00000262498 PIP4K2BP78356 416 aa19.68■□□□□ 0.74
CFAP20-201ENST00000262498 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.67■□□□□ 0.74
CFAP20-201ENST00000262498 GGT6Q6P531 493 aa19.66■□□□□ 0.74
CFAP20-201ENST00000262498 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CFAP20-201ENST00000262498 TOM1O60784 492 aa19.64■□□□□ 0.73
CFAP20-201ENST00000262498 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.63■□□□□ 0.73
CFAP20-201ENST00000262498 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms