RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261893.8

LACTB-201, Transcript of lactamase beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LACTB, Length 1,972 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB-201ENST00000261893 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.91■■■■□ 3.5
LACTB-201ENST00000261893 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
LACTB-201ENST00000261893 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
LACTB-201ENST00000261893 KDM6BO15054 1643 aa36.87■■■■□ 3.49
LACTB-201ENST00000261893 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.85■■■■□ 3.49
LACTB-201ENST00000261893 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
LACTB-201ENST00000261893 MIER1Q8N108 512 aa36.81■■■■□ 3.48
LACTB-201ENST00000261893 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.8■■■■□ 3.48
LACTB-201ENST00000261893 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.8■■■■□ 3.48
LACTB-201ENST00000261893 TONSLQ96HA7 1378 aa36.79■■■■□ 3.48
LACTB-201ENST00000261893 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.77■■■■□ 3.48
LACTB-201ENST00000261893 TRIM52Q96A61 297 aa36.77■■■■□ 3.48
LACTB-201ENST00000261893 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.76■■■■□ 3.48
LACTB-201ENST00000261893 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
LACTB-201ENST00000261893 ADGRL2O95490 1459 aa36.73■■■■□ 3.47
LACTB-201ENST00000261893 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.69■■■■□ 3.46
LACTB-201ENST00000261893 NCOA1Q15788 1441 aa36.68■■■■□ 3.46
LACTB-201ENST00000261893 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
LACTB-201ENST00000261893 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.67■■■■□ 3.46
LACTB-201ENST00000261893 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
LACTB-201ENST00000261893 OSCARQ8IYS5 282 aa36.67■■■■□ 3.46
LACTB-201ENST00000261893 ABCC2Q92887 1545 aa36.66■■■■□ 3.46
LACTB-201ENST00000261893 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.63■■■■□ 3.45
LACTB-201ENST00000261893 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.61■■■■□ 3.45
LACTB-201ENST00000261893 PREX2Q70Z35 1606 aa36.56■■■■□ 3.44
LACTB-201ENST00000261893 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.56■■■■□ 3.44
LACTB-201ENST00000261893 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.55■■■■□ 3.44
LACTB-201ENST00000261893 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.51■■■■□ 3.44
LACTB-201ENST00000261893 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.5■■■■□ 3.43
LACTB-201ENST00000261893 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.49■■■■□ 3.43
LACTB-201ENST00000261893 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.48■■■■□ 3.43
LACTB-201ENST00000261893 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.45■■■■□ 3.43
LACTB-201ENST00000261893 PZPP20742 1482 aa36.45■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 MBD5Q9P267 1494 aa36.45■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 TSPY4P0CV99 314 aa36.44■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 TSPY10P0CW01 314 aa36.44■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.43■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.42■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.4■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.38■■■■□ 3.42
LACTB-201ENST00000261893 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
LACTB-201ENST00000261893 FOXD1Q16676 465 aa36.37■■■■□ 3.41
LACTB-201ENST00000261893 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
LACTB-201ENST00000261893 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.35■■■■□ 3.41
LACTB-201ENST00000261893 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.35■■■■□ 3.41
LACTB-201ENST00000261893 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.34■■■■□ 3.41
LACTB-201ENST00000261893 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
LACTB-201ENST00000261893 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.3■■■■□ 3.4
LACTB-201ENST00000261893 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.3■■■■□ 3.4
LACTB-201ENST00000261893 KIF15Q9NS87 1388 aa36.28■■■■□ 3.4
LACTB-201ENST00000261893 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.28■■■■□ 3.4
LACTB-201ENST00000261893 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.27■■■■□ 3.4
LACTB-201ENST00000261893 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.27■■■■□ 3.4
LACTB-201ENST00000261893 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.25■■■■□ 3.39
LACTB-201ENST00000261893 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.25■■■■□ 3.39
LACTB-201ENST00000261893 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
LACTB-201ENST00000261893 PLCH2O75038 1416 aa36.2■■■■□ 3.39
LACTB-201ENST00000261893 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
LACTB-201ENST00000261893 NUP155O75694 1391 aa36.18■■■■□ 3.38
LACTB-201ENST00000261893 PKD2Q13563 968 aa36.17■■■■□ 3.38
LACTB-201ENST00000261893 KCNH8Q96L42 1107 aa36.17■■■■□ 3.38
LACTB-201ENST00000261893 PLXNC1O60486 1568 aa36.12■■■■□ 3.37
LACTB-201ENST00000261893 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.09■■■■□ 3.37
LACTB-201ENST00000261893 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.09■■■■□ 3.37
LACTB-201ENST00000261893 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.07■■■■□ 3.36
LACTB-201ENST00000261893 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
LACTB-201ENST00000261893 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.04■■■■□ 3.36
LACTB-201ENST00000261893 ABCC1P33527 1531 aa36.03■■■■□ 3.36
LACTB-201ENST00000261893 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.02■■■■□ 3.36
LACTB-201ENST00000261893 UNC13BO14795 1591 aa36.01■■■■□ 3.36
LACTB-201ENST00000261893 NBPF8Q3BBV2 869 aa36■■■■□ 3.35
LACTB-201ENST00000261893 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.99■■■■□ 3.35
LACTB-201ENST00000261893 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.98■■■■□ 3.35
LACTB-201ENST00000261893 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.98■■■■□ 3.35
LACTB-201ENST00000261893 ANP32CO43423 234 aa35.93■■■■□ 3.34
LACTB-201ENST00000261893 ERBINQ96RT1 1412 aa35.92■■■■□ 3.34
LACTB-201ENST00000261893 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.9■■■■□ 3.34
LACTB-201ENST00000261893 CCER2I3L3R5 266 aa35.89■■■■□ 3.34
LACTB-201ENST00000261893 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.87■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.87■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.86■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.86■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.85■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.85■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.84■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.83■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.83■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.83■■■■□ 3.33
LACTB-201ENST00000261893 ASXL2Q76L83 1435 aa35.8■■■■□ 3.32
LACTB-201ENST00000261893 FANCAO15360 1455 aa35.78■■■■□ 3.32
LACTB-201ENST00000261893 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.76■■■■□ 3.32
LACTB-201ENST00000261893 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
LACTB-201ENST00000261893 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
LACTB-201ENST00000261893 CCDC7Q96M83 1385 aa35.75■■■■□ 3.31
LACTB-201ENST00000261893 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.75■■■■□ 3.31
LACTB-201ENST00000261893 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.73■■■■□ 3.31
LACTB-201ENST00000261893 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms